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liuyan_54321

新虫 (初入文坛)

[求助] 3个片段的重叠延伸pcr,pcr反应条件?

最近我在做3个片段的重叠延伸pcr,对于3个片段的重叠延伸时的pcr反应条件应该怎么设置,还有我使用的是50ul的体系,模板量加多少比较好,期待各位高手的协助,谢谢
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liuyan_54321

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by munificent at 2013-04-20 20:06:46
刚做了10个片段的overlap pcr,非常顺利。
方法可参考Nat Protoc. 2006;1(2):791-7.
PCR-based accurate synthesis of long DNA sequences.
文章里用overlap pcr将小片段组装成较大的片段。

个人感觉片段割胶 ...

谢谢!非常感谢
4楼2013-04-23 11:38:56
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liygmail

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励应助! 2013-04-23 14:14:52
三片段融合pcr,退火温度取决于外引物以及内引物重叠区Tm值,可以温度梯度优化,根据所用的DNA聚合酶扩增速度设定延伸时间,模板100-200ng,其中三片段摩尔比保持1:1:1,加入外引物,扩增30-35个循环

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2013-04-20 17:12:28
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munificent

铁虫 (初入文坛)

★ ★ ★
gyesang: 金币+3, 鼓励交流! 2013-04-23 14:15:13
刚做了10个片段的overlap pcr,非常顺利。
方法可参考Nat Protoc. 2006;1(2):791-7.
PCR-based accurate synthesis of long DNA sequences.
文章里用overlap pcr将小片段组装成较大的片段。

个人感觉片段割胶回收后,在体系里每个片段加20纳克就足够了。
片段之间的overlap至少要有20bp,在50-55度退火。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2013-04-20 20:06:46
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liuyan_54321

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by liygmail at 2013-04-20 17:12:28
三片段融合pcr,退火温度取决于外引物以及内引物重叠区Tm值,可以温度梯度优化,根据所用的DNA聚合酶扩增速度设定延伸时间,模板100-200ng,其中三片段摩尔比保持1:1:1,加入外引物,扩增30-35个循环

谢谢
5楼2013-04-23 11:40:07
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