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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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aixiaok110

木虫 (著名写手)

[求助] 高斯优化查看结构,发现H-O键消失,但是H原子还在?

高斯优化查看结构,发现H-O键消失,但是H原子还在?优化正常结束,四个YES?是神马情况?用GAUSSVIEW看的,GJF文件查看H-O键是连接的

[ Last edited by aixiaok110 on 2013-4-18 at 13:31 ]
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ZJboy

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

下次问这种问题,建议把计算的方法与基组一并给出。谢谢。
另外,GJF是输入文件,其实就是优化前O与H离得比较近,优化后远了。
这应该是你想表达的意思吧。
9楼2013-04-18 22:04:35
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vigaryang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+2 2013-04-18 14:25:30
aixiaok110: 金币+2, ★★★很有帮助, 感谢你的帮助! 2013-04-21 21:39:42
GaussView对两个原子成键与否的判断是很武断的,GaussView中键消失并不意味着真的发生了键的断裂。只要H原子和O原子的距离没有变得太大,可以认为键没有断。
2楼2013-04-18 13:57:05
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aixiaok110

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by vigaryang at 2013-04-18 13:57:05
GaussView对两个原子成键与否的判断是很武断的,GaussView中键消失并不意味着真的发生了键的断裂。只要H原子和O原子的距离没有变得太大,可以认为键没有断。

那是不是可以人为的再把这个键连接上吗?在COPY优化后的结构图时?
3楼2013-04-18 16:17:36
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aixiaok110

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by vigaryang at 2013-04-18 13:57:05
GaussView对两个原子成键与否的判断是很武断的,GaussView中键消失并不意味着真的发生了键的断裂。只要H原子和O原子的距离没有变得太大,可以认为键没有断。

优化的结构是有晶体文件CIF转化为mol2,然后有gaussviewda打开,转化为gjf文件计算的,不知这样也会断裂消失吗?
4楼2013-04-18 16:28:20
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