应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 高斯优化查看结构，发现H-O键消失，但是H原子还在？
51/1返回列表
查看: 4385  |  回复: 31
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

aixiaok110

木虫 (著名写手)

[求助] 高斯优化查看结构，发现H-O键消失，但是H原子还在？

高斯优化查看结构，发现H-O键消失，但是H原子还在？优化正常结束，四个YES？是神马情况？用GAUSSVIEW看的，GJF文件查看H-O键是连接的

[ Last edited by aixiaok110 on 2013-4-18 at 13:31 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-04-18 13:30:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZJboy

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

下次问这种问题，建议把计算的方法与基组一并给出。谢谢。
另外，GJF是输入文件，其实就是优化前O与H离得比较近，优化后远了。
这应该是你想表达的意思吧。
赞一下 回复此楼
9楼2013-04-18 22:04:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 32 个回答

vigaryang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+2 2013-04-18 14:25:30
aixiaok110: 金币+2, ★★★很有帮助, 感谢你的帮助！ 2013-04-21 21:39:42
GaussView对两个原子成键与否的判断是很武断的，GaussView中键消失并不意味着真的发生了键的断裂。只要H原子和O原子的距离没有变得太大，可以认为键没有断。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2013-04-18 13:57:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aixiaok110

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by vigaryang at 2013-04-18 13:57:05
GaussView对两个原子成键与否的判断是很武断的，GaussView中键消失并不意味着真的发生了键的断裂。只要H原子和O原子的距离没有变得太大，可以认为键没有断。

那是不是可以人为的再把这个键连接上吗？在COPY优化后的结构图时？
赞一下 回复此楼
3楼2013-04-18 16:17:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aixiaok110

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by vigaryang at 2013-04-18 13:57:05
GaussView对两个原子成键与否的判断是很武断的，GaussView中键消失并不意味着真的发生了键的断裂。只要H原子和O原子的距离没有变得太大，可以认为键没有断。

优化的结构是有晶体文件CIF转化为mol2，然后有gaussviewda打开，转化为gjf文件计算的，不知这样也会断裂消失吗？
赞一下 回复此楼
4楼2013-04-18 16:28:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 32 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +12 大萍1987 2026-08-20 15/750 2026-08-23 20:44 by 大萍1987
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 5/250 2026-08-23 19:22 by lXgU0RvNTDC9
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 5/250 2026-08-23 19:10 by lXgU0RvNTDC9
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 8/400 2026-08-23 18:58 by lXgU0RvNTDC9
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 9/450 2026-08-23 18:46 by lXgU0RvNTDC9
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 h4CP7TrQR8Lg 2026-08-22 3/150 2026-08-23 16:30 by lXgU0RvNTDC9
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 4/200 2026-08-23 15:30 by KM5EcsNQRBPn
[基金申请] 什么时候开奖？ +9 CrisMessi 2026-08-18 10/500 2026-08-23 12:03 by 丶昵称占用
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 5/250 2026-08-23 07:41 by OEbVnUOu01ol
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 5/250 2026-08-23 04:07 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 4/200 2026-08-23 04:04 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:55 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭