应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 高斯优化查看结构，发现H-O键消失，但是H原子还在？
51/1返回列表
查看: 3942  |  回复: 31
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

aixiaok110

木虫 (著名写手)

[求助] 高斯优化查看结构，发现H-O键消失，但是H原子还在？

高斯优化查看结构，发现H-O键消失，但是H原子还在？优化正常结束，四个YES？是神马情况？用GAUSSVIEW看的，GJF文件查看H-O键是连接的

[ Last edited by aixiaok110 on 2013-4-18 at 13:31 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-04-18 13:30:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aixiaok110

木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by ZJboy at 2013-04-18 18:08:37
因为这个分子中的这个键比较弱吧。和分子结构的输入模型的来源无太大关系。另外，不要迷信单晶结构数据........

单晶CIF中H-O键长为0.8508，是比较合理的值，而gaussian   计算的键长达到1.022，超过了H-O键的正常的值很多了呢？
赞一下 回复此楼
7楼2013-04-18 20:24:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 32 个回答

vigaryang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+2 2013-04-18 14:25:30
aixiaok110: 金币+2, ★★★很有帮助, 感谢你的帮助！ 2013-04-21 21:39:42
GaussView对两个原子成键与否的判断是很武断的，GaussView中键消失并不意味着真的发生了键的断裂。只要H原子和O原子的距离没有变得太大，可以认为键没有断。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2013-04-18 13:57:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aixiaok110

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by vigaryang at 2013-04-18 13:57:05
GaussView对两个原子成键与否的判断是很武断的，GaussView中键消失并不意味着真的发生了键的断裂。只要H原子和O原子的距离没有变得太大，可以认为键没有断。

那是不是可以人为的再把这个键连接上吗？在COPY优化后的结构图时？
赞一下 回复此楼
3楼2013-04-18 16:17:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aixiaok110

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by vigaryang at 2013-04-18 13:57:05
GaussView对两个原子成键与否的判断是很武断的，GaussView中键消失并不意味着真的发生了键的断裂。只要H原子和O原子的距离没有变得太大，可以认为键没有断。

优化的结构是有晶体文件CIF转化为mol2，然后有gaussviewda打开，转化为gjf文件计算的，不知这样也会断裂消失吗？
赞一下 回复此楼
4楼2013-04-18 16:28:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 32 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭