24小时热门版块排行榜    

查看: 3827  |  回复: 31
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

aixiaok110

木虫 (著名写手)

[求助] 高斯优化查看结构,发现H-O键消失,但是H原子还在?

高斯优化查看结构,发现H-O键消失,但是H原子还在?优化正常结束,四个YES?是神马情况?用GAUSSVIEW看的,GJF文件查看H-O键是连接的

[ Last edited by aixiaok110 on 2013-4-18 at 13:31 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aixiaok110

木虫 (著名写手)

引用回帖:
30楼: Originally posted by 怡飘的云彩 at 2014-04-17 20:25:34
想问楼主最后是怎么处理的,因为我今天也遇到了这样的问题,基组和方法和楼主都是一样的。谢谢!

你吧所有这帖子都看一遍,从别人对我的回答就知道了啊,GaussView是从键的距离大小来认为成键的,算个键级,只要O-H的键长在的范围就不理它,假如这样拷贝图时,你自己在H,O之间加一个单键就是了
31楼2014-04-17 23:07:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 32 个回答

vigaryang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+2 2013-04-18 14:25:30
aixiaok110: 金币+2, ★★★很有帮助, 感谢你的帮助! 2013-04-21 21:39:42
GaussView对两个原子成键与否的判断是很武断的,GaussView中键消失并不意味着真的发生了键的断裂。只要H原子和O原子的距离没有变得太大,可以认为键没有断。
2楼2013-04-18 13:57:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aixiaok110

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by vigaryang at 2013-04-18 13:57:05
GaussView对两个原子成键与否的判断是很武断的,GaussView中键消失并不意味着真的发生了键的断裂。只要H原子和O原子的距离没有变得太大,可以认为键没有断。

那是不是可以人为的再把这个键连接上吗?在COPY优化后的结构图时?
3楼2013-04-18 16:17:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aixiaok110

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by vigaryang at 2013-04-18 13:57:05
GaussView对两个原子成键与否的判断是很武断的,GaussView中键消失并不意味着真的发生了键的断裂。只要H原子和O原子的距离没有变得太大,可以认为键没有断。

优化的结构是有晶体文件CIF转化为mol2,然后有gaussviewda打开,转化为gjf文件计算的,不知这样也会断裂消失吗?
4楼2013-04-18 16:28:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见