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gaussian halt optimization without error message in out file
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when I use gaussian 03 to do optimization ,why it always halt without any error hint in the out file? my system is a complex with a ligand and its part of active pocket in the protein This is my out file: thanks input file :.com output file:.out mol2 file:.mol2 |
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2013-04-16 12:49:41, 168.97 K
2013-04-16 12:49:42, 17.18 K
2013-04-16 12:49:43, 28.33 K
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【答案】应助回帖
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从你的结果文件还真的是难以看出是什么问题，刚结束401.exe，还没开始迭代计算。没做过蛋白质计算，不过最大循环圈数设这么没什么意义吧，而且内存需求会随最大循环次数的增加而增加。所以要不你就试着先别用那么的循环圈数。可以先设在1000试试，不行再加呗，然后再加大内存，我记得貌似1MW=8MB，你设2600MW就还不到24G。内存看你计算中心的能力了，4核每核10Gb也可以。 另外建议修改关键字部分 #p opt b3lyp/3-21g* scf=(maxcycle=1000) geom=connectivity 加p是为了看更多信息，把圈数设为1000也是尝试，仅供参考。 |
12楼2013-04-19 20:34:39
again891106
木虫 (著名写手)
苦行僧
- 应助: 185 (高中生)
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- 专业: 无机纳米化学
2楼2013-04-16 13:11:56
3楼2013-04-16 20:10:19
4楼2013-04-16 23:23:54