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yoyo单眼皮

铁虫 (小有名气)

[求助] 3`RACE求助!十分诡异!~~~~~~~~~~求大神指点

3·RACE做出来之后 有三条带 一条1500bp左右的条带 下面有300bp拖尾 然后我采取胶回收  回收了好多次终于成功回收了1500bp的带(但是条带很浅)连接转化 长了白斑 摇菌 菌液PCR 这时候神奇的事情发生了 没有1500的带 只有300的带 我想死!! 真的很诡异 求大神解释帮助!
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yujitianqing

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
yoyo单眼皮(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-04-29 14:37:43
说明你引物设计特异性不好,可在你目的基因的300bp处非特异性结合……你可再重新设个引物……
5楼2013-04-16 08:58:44
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hellolin

金虫 (小有名气)

你用的是什么引物做的PCR
scienceguy
2楼2013-04-14 22:37:26
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pxq88888

铜虫 (初入文坛)

很正常,我的也有这种情况,就是感觉不是自己要的那条带,总是差那么一点点
3楼2013-04-15 21:28:23
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守好我的道

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
yoyo单眼皮: 金币+4 2013-04-16 14:30:15
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-04-29 14:37:34
呵呵,结果没出来就想死,可是,死了以后还是不出来。
实验重现:你的PCR结果有三条带,目标是1500bp,有300bp的拖尾杂带,还有一条没说。
1500bp的目标条带,回收了好几次才回收到了。连转长白班,菌液PCR 却出现了300bp的条带。
个人认为:你的回收1500bp的产物中有300bp的杂带。也许很少,你在胶图上无法看见。只见1500bp的条带了。
容易理解的是:300bp的条带,对比起1500bp的条带,连接的效率要高很多。
解决:个人建议,从PCR这步控制,提高PCR产物的特异性。包括模板的制备,引物的设计,循环的设计,酶的选用,等等。目标是拿到单一的目标条带。便与下游的回收和连接操作了。有了这样的上游实验作为保证,也许出来的菌液PCR 的结果就不一样了。加油!!!
4楼2013-04-16 01:14:08
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