应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » pdb文件打开二硫键
51/1返回列表
查看: 1480  |  回复: 6
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

wanglang1987

铜虫 (小有名气)

[求助] pdb文件打开二硫键

我想在gromacs模拟前打开二硫键，不知道什么方法可以？求助大家。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
滴答
1楼2013-04-08 19:20:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanglang1987

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by spirte雷 at 2013-04-13 07:23:21
现在我知道的是两种方法，1.pdb2gmx命令的时候加 -ss,选择n即不保留二硫键。2.将形成二硫键半胱氨酸的进行点突变。
PS.你是不是科大的小王？

今天还想请教你一个问题：请题用-ss命令打开二硫键时，有六个二硫键，但是出来的只有四个连接与否选择，其他两个二硫键怎么没有选择呀？？这个是什么原因？
赞一下 回复此楼
滴答
6楼2013-05-02 12:53:11
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

spirte雷

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-04-13 08:47:17
wanglang1987: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢 2013-04-15 10:26:22
现在我知道的是两种方法，1.pdb2gmx命令的时候加 -ss,选择n即不保留二硫键。2.将形成二硫键半胱氨酸的进行点突变。
PS.你是不是科大的小王？
赞一下 回复此楼
用心体验就好
2楼2013-04-13 07:23:21
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanglang1987

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by spirte雷 at 2013-04-13 07:23:21
现在我知道的是两种方法，1.pdb2gmx命令的时候加 -ss,选择n即不保留二硫键。2.将形成二硫键半胱氨酸的进行点突变。
PS.你是不是科大的小王？

嗯嗯，
回复此楼
滴答
3楼2013-04-13 12:26:11
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

spirte雷

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wanglang1987 at 2013-04-13 12:26:11
嗯嗯，...

在这里又碰到你，好巧啊
赞一下 回复此楼
用心体验就好
4楼2013-04-13 15:05:20
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭