版块导航: 正在加载中...

登录注册

应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

胡博洋的洋

金虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1157.8
帖子: 93
在线: 123.9小时
虫号: 2351552
注册: 2013-03-16
性别: GG
专业: 理论和计算化学

[求助] 求助各位前辈帮我看看安装并行安装LAMMPS中的问题

各位前辈好，我使用的是 Makefile.mkl。设置完后在 src 目录下 make clean-all，接着 make mkl
然后就会出现

compute_voronoi_atom.cpp(31): catastrophic error: cannot open source file "voro++.hh"
#include "voro++.hh"
^

compilation aborted for compute_voronoi_atom.cpp (code 4)
make[1]: *** [compute_voronoi_atom.o] Error 4
make[1]: Leaving directory `/home/hu/mnt/lmp/src/Obj_mkl'
make: *** [mkl] Error 2
这个是怎么回事啊？拜托了各位了！

回复此楼

» 猜你喜欢

寻求一种能扛住强氧化性腐蚀性的容器密封件已经有7人回复
到新单位后，换了新的研究方向，没有团队，持续积累2区以上论文，能申请到面上吗已经有8人回复
申请2026年博士已经有6人回复
请问哪里可以有青B申请的本子可以借鉴一下。已经有5人回复
天津工业大学郑柳春团队欢迎化学化工、高分子化学或有机合成方向的博士生和硕士生加入已经有5人回复
2025冷门绝学什么时候出结果已经有7人回复
请问有评职称，把科研教学业绩算分排序的高校吗已经有6人回复
Bioresource Technology期刊，第一次返修的时候被退回好几次了已经有7人回复
请问下大家为什么这个铃木偶联几乎不反应呢已经有5人回复
康复大学泰山学者周祺惠团队招收博士研究生已经有6人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

LAMMPS并行计算的问题（cpu——time关系）已经有17人回复
安装lammps并行编译时出现的问题已经有5人回复
【求助】LAMMPS-运行报错已经有9人回复
【求助】lammps势的选择已经有3人回复
【求助】lammps安装过程中，在安装fftw的过程中遇到问题已经有8人回复
【求助】lammps最适合安装在哪一个版本的linux系统中？已经有7人回复
【求助】遇到LAMMPS安装问题，敬请高手相助已经有6人回复
【求助】fedora中LAMMPS编译问题已经有4人回复
【求助】MS建模导入lammps问题求救已经有14人回复
【求助】Lammps 多机并行的问题已经有11人回复
【求助】LAMMPS中非周期性边界条件和Born-Mayer-Huggins势函数不会设置已经有4人回复

不得求之

1楼2013-04-05 22:11:41

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

胡博洋的洋

金虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1157.8
帖子: 93
在线: 123.9小时
虫号: 2351552
注册: 2013-03-16
性别: GG
专业: 理论和计算化学

引用回帖:

2楼: Originally posted by Bessel at 2013-04-06 05:01:45
错误提示很明白了，你没装voronoi包, 如果用不着的话，就 make no voronoi 。

按照这个步骤来
1 make clean-all
2 make yes-all
3 make no kim
4 make no voronoi
5 make mkl

因为我是第一次接触Linux 系统，改成
make no-voronoi就可以移除了，但是继续
make mkl 后又会有

fft3d_cuda.h(80): catastrophic error: cannot open source file "cuda_runtime.h"
#include "cuda_runtime.h"
这个也没找到，是不是也应该移除呢？

赞一下

回复此楼

不得求之

4楼2013-04-06 13:57:32

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 6 个回答

Bessel

木虫 (正式写手)

模拟EPI: 2
应助: 47 (小学生)
金币: 1505.5
散金: 4755
红花: 8
帖子: 609
在线: 234.1小时
虫号: 370174
注册: 2007-05-13
专业: 凝聚态物性I:结构、力学和

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-04-06 09:03:36

错误提示很明白了，你没装voronoi包, 如果用不着的话，就 make no voronoi 。

按照这个步骤来
1 make clean-all
2 make yes-all
3 make no kim
4 make no voronoi
5 make mkl

赞一下

回复此楼

2楼2013-04-06 05:01:45

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

胡博洋的洋

金虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1157.8
帖子: 93
在线: 123.9小时
虫号: 2351552
注册: 2013-03-16
性别: GG
专业: 理论和计算化学

引用回帖:

你好，当我做到
make yes-all
后我能看见有显示：
make[1]: Entering directory `/home/hu/mnt/lmp/src'
Installing package voronoi
然后我就以为它安装了，就
make mkl，结果错误和原来一样。
然后我从头开始，
make clean-all
make yes-all
make no kim了之后显示
[hu@mgt src]$ make no kim
make: *** [no] Error 1
make no voronoi之后也显示
[hu@mgt src]$ make no voronoi
make: *** [no] Error 1
然后不知道怎么办，我就继续
make mkl
发现错误和原来一样····，

是不是我Makefile.mkl里面的路径没有设置好的问题？

赞一下

回复此楼

不得求之

3楼2013-04-06 09:53:59

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

Bessel

木虫 (正式写手)

模拟EPI: 2
应助: 47 (小学生)
金币: 1505.5
散金: 4755
红花: 8
帖子: 609
在线: 234.1小时
虫号: 370174
注册: 2007-05-13
专业: 凝聚态物性I:结构、力学和

【答案】应助回帖

★ ★ ★
胡博洋的洋: 金币+3, ★★★很有帮助, 谢谢，最后导师帮我看了，结果什么package都没让我装，然后就硬生生的装好了····· 2013-04-06 22:58:45

引用回帖:

4楼: Originally posted by 胡博洋的洋 at 2013-04-06 07:57:32
因为我是第一次接触Linux 系统，改成
make no-voronoi就可以移除了，但是继续
make mkl 后又会有

fft3d_cuda.h(80): catastrophic error: cannot open source file "cuda_runtime.h"
#include & ...

Lammps有自带的lib，选择你需要的在make之前要先编译好。建议你把Lammps的说明文件，关于安装的部分好好读读。

赞一下(1人)

回复此楼

5楼2013-04-06 16:13:05

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 6 个回答