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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 求助各位前辈帮我看看安装并行安装LAMMPS中的问题
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胡博洋的洋

金虫 (小有名气)

[求助] 求助各位前辈帮我看看安装并行安装LAMMPS中的问题

各位前辈好，我使用的是 Makefile.mkl。设置完后 在 src 目录下 make clean-all，接着 make mkl
然后就会出现

compute_voronoi_atom.cpp(31): catastrophic error: cannot open source file "voro++.hh"
  #include "voro++.hh"
                      ^

compilation aborted for compute_voronoi_atom.cpp (code 4)
make[1]: *** [compute_voronoi_atom.o] Error 4
make[1]: Leaving directory `/home/hu/mnt/lmp/src/Obj_mkl'
make: *** [mkl] Error 2
这个是怎么回事啊？拜托了各位了！
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不得求之
1楼 2013-04-05 22:11:41
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胡博洋的洋

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by Bessel at 2013-04-06 05:01:45
错误提示很明白了，你没装voronoi包, 如果用不着的话，就 make no voronoi 。

按照这个步骤来
1 make clean-all
2 make yes-all
3 make no kim
4 make no voronoi
5 make mkl

你好，当我做到
make yes-all
后我能看见有显示：
make[1]: Entering directory `/home/hu/mnt/lmp/src'
Installing package voronoi
然后我就以为它安装了，就
make mkl，结果错误和原来一样。
然后我从头开始，
make clean-all
make yes-all
make no kim了之后显示
[hu@mgt src]$ make no kim
make: *** [no] Error 1
make no voronoi之后也显示
[hu@mgt src]$ make no voronoi
make: *** [no] Error 1
然后不知道怎么办，我就继续
make mkl
发现错误和原来一样····，
是不是我Makefile.mkl里面的路径没有设置好的问题？
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不得求之
3楼2013-04-06 09:53:59
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查看全部 6 个回答

Bessel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-04-06 09:03:36
错误提示很明白了，你没装voronoi包, 如果用不着的话，就 make no voronoi 。

按照这个步骤来
1 make clean-all
2 make yes-all
3 make no kim
4 make no voronoi
5 make mkl
赞一下 回复此楼
2楼2013-04-06 05:01:45
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胡博洋的洋

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by Bessel at 2013-04-06 05:01:45
错误提示很明白了，你没装voronoi包, 如果用不着的话，就 make no voronoi 。

按照这个步骤来
1 make clean-all
2 make yes-all
3 make no kim
4 make no voronoi
5 make mkl

因为我是第一次接触Linux 系统，改成
make no-voronoi就可以移除了，但是继续
make mkl 后又会有

fft3d_cuda.h(80): catastrophic error: cannot open source file "cuda_runtime.h"
  #include "cuda_runtime.h"
这个也没找到，是不是也应该移除呢？
赞一下 回复此楼
不得求之
4楼2013-04-06 13:57:32
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Bessel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
胡博洋的洋: 金币+3, ★★★很有帮助, 谢谢，最后导师帮我看了，结果什么package都没让我装，然后就硬生生的装好了····· 2013-04-06 22:58:45
引用回帖:
4楼: Originally posted by 胡博洋的洋 at 2013-04-06 07:57:32
因为我是第一次接触Linux 系统，改成
make no-voronoi就可以移除了，但是继续
make mkl 后又会有

fft3d_cuda.h(80): catastrophic error: cannot open source file "cuda_runtime.h"
  #include & ...

Lammps有自带的lib，选择你需要的在make之前要先编译好。建议你把Lammps的说明文件，关于安装的部分好好读读。
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5楼2013-04-06 16:13:05
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