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急~用MEGA构建的进化树上面数值好多都是0,这个是什么意思
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wawa13998
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急~用MEGA构建的进化树上面数值好多都是0,这个是什么意思
从NCBI上下载了70种鳞翅目昆虫的COII基因序列,构建进化树,用的MEGA。出现好多0,是什么意思,如图。
823C6FF1-7116-463A-A585-B7676B0DCEDD.png
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2013-04-04 21:58:59
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wizardfan
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一般来说,这个是bootstrap value,简单来说,可以看成是这个进化度的可靠性。
但是很少见到0的数值,一般只显示50以上,50以下的话就基本不可靠了。
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3楼
2013-04-05 06:26:17
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wawa13998
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3楼
:
Originally posted by
wizardfan
at 2013-04-05 06:26:17
一般来说,这个是bootstrap value,简单来说,可以看成是这个进化度的可靠性。
但是很少见到0的数值,一般只显示50以上,50以下的话就基本不可靠了。
谢谢~难道是我构建的方法不对?
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4楼
2013-04-05 09:36:10
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wizardfan: 金币+2, 谢谢参与,虽然你的回答值得推敲。一般是进化差异太小,导致各种可能性的树
2013-04-06 08:37:42
wawa13998: 金币+5, 谢谢~
2013-04-07 14:32:27
主要是你的序列之间的差异性太大,这个没有太大关系,但为了美观还是设置一下value,凡是小于50%的隐藏就是了,主要是你对于这个树的分析,貌似这样画也不太好看,建议你看看一些paper中的树,进行参考。
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5楼
2013-04-05 11:35:08
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4楼
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Originally posted by
wawa13998
at 2013-04-05 09:36:10
谢谢~难道是我构建的方法不对?...
请仔细列出步骤
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6楼
2013-04-06 08:38:14
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