| 查看: 5078 | 回复: 8 | ||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||
[交流]
如何用open babel软件把PDB格式的文件转换成mol2格式？
|
||||
| 用open babel转换mol2格式，需要勾选中间的选项吗？为什么保存到指定位置后总是不能显示？ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 酶的资料 |
» 猜你喜欢
基金系统什么内容也没有
已经有6人回复
-
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有17人回复
-
国自然面上复盘~欢迎讨论
已经有12人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有9人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有3人回复
-
哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识
已经有6人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
面上合作单位盖章
已经有5人回复
-
导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！
已经有7人回复
-
申请删除本帖
已经有7人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 如何将pdb文件批量转换为mol2格式文件？
已经有10人回复
- 分子对接中mol文件用open babel 转化为mol2
已经有11人回复
- 【求助】ChemDraw中画出的手性分子为何经过open babel转换后，就不显示手性了呢？
已经有3人回复
- 【求助】如何让DS里画的格式，转化到SYBYL
已经有16人回复
送鲜花一朵 
4楼2013-04-04 09:39:51
2楼2013-04-03 22:42:31
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-04-06 09:06:29
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-04-06 09:06:29
| 用命令吧。babel -ipdb filename.pdb -omol2 filename.mol2 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
3楼2013-04-03 23:40:16
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
| 你用的是什么系统，如果是linux系统的话，直接在终端下面把我说的命令输入就可以将你的分子从pdb转换成mol2。如果是windows系统的话，应该可以。试试吧。没有用过openbabel的图形界面。如果还不懂，到www.openbabel.org上去找答案。 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
5楼2013-04-04 18:47:08
