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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » ML法构建真菌系统发育树
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zhanghh1127

金虫 (正式写手)

[交流] ML法构建真菌系统发育树

请问下大家在用paup建ML树的时候用不用modeltest自带的MLsearch.txt 这个文件？

[ Last edited by zhanghh1127 on 2013-3-31 at 23:40 ]
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1楼 2013-03-31 23:37:06
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rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
1949stone: MolEPI+1, 很好 鼓励交流 2013-04-06 17:38:49
手边没有合适的例子，Bayes的说明说里有明确的例子，会告诉你如果将有用的信息复制至*.nex文件中。（好久没在ME或是MPE这样的Paper中看到MP树）。
祝好
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36楼2013-04-06 15:52:51
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查看全部 42 个回答

userhung

禁虫 (文学泰斗)
★
zhanghh1127(金币+1): 谢谢参与
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3101141
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2292473
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7楼2013-04-01 05:39:18
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rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★
zhanghh1127(金币+1): 谢谢参与
myprayer: 金币+2, 赠人玫瑰手有余香。生物版块欢迎你的无私奉献。 2013-04-02 09:07:40
如果你的序列够长，信息量很多，建议使用PhyML，Paup相当浪费时间。
祝好。
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zhanghh1127
8楼2013-04-01 14:43:56
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zhanghh1127

金虫 (正式写手)
送鲜花一朵
zhanghh1127: 回帖置顶 2013-04-01 18:54:09
zhanghh1127: 取消置顶 2013-04-04 13:47:15
引用回帖:
8楼: Originally posted by rommel1941 at 2013-04-01 14:43:56
如果你的序列够长，信息量很多，建议使用PhyML，Paup相当浪费时间。
祝好。

序列也不长  用的ITS这一段 我用modeltest检测出模型之后是不是直接套用它自带的ML建树的命令在PAUP里面直接运行？
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9楼2013-04-01 18:52:31
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