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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 关于lammps中某种atom个数的统计方法
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zhang_jaj

木虫 (正式写手)

[求助] 关于lammps中某种atom个数的统计方法

大家好，我先用coord统计了某一步的配位数，想通过变量把这里面配位数是12的atom个数记一下，不知道该怎么实现，主要是想看每一步这种atom的个数变化。
下面这个下代码我知道有许多错误，谁能帮修改下，还有lammps有自加和的功能吗？
compute            1 all coord/atom 4.0
variable         y equal 0
label            loop
variable        i loop 1280
varialbe        x atom c_1
if "$x == 12" then "variable y equal$y+1"
next             i
谢谢！

[ Last edited by zhang_jaj on 2013-3-31 at 08:26 ]
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1楼 2013-03-29 23:09:39
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zhang_jaj

木虫 (正式写手)
自己顶一下，希望谁能给说下在lammps怎么实现，我知道编个程序可以，就是想在lammps同步做了并行速度较快
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2楼2013-03-31 08:30:35
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weihai203

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-04-02 08:31:20
这个以前没用过，很有趣。
变量名应该避免使用x,y等系统量，另外这里:  varialbe  a atom c_1[], 要用括号吧。但是不知道这样每次随着i 的增加，是否如愿读到了第 i 个原子的c_1。
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3楼2013-04-01 10:20:32
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zhang_jaj

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by weihai203 at 2013-04-01 10:20:32
这个以前没用过，很有趣。
变量名应该避免使用x,y等系统量，另外这里:  varialbe  a atom c_1[], 要用括号吧。但是不知道这样每次随着i 的增加，是否如愿读到了第 i 个原子的c_1。

我记得我加上[]了呀，忘了估计。但是还是有问题，这个方括号好像确实能起到循环作用，但是问题是if判断后那个变量能不能自加1，目前看好像不能啊。。。lammps这个if命令不强大啊。
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4楼2013-04-01 19:24:16
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weihai203

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhang_jaj at 2013-04-01 19:24:16
我记得我加上[]了呀，忘了估计。但是还是有问题，这个方括号好像确实能起到循环作用，但是问题是if判断后那个变量能不能自加1，目前看好像不能啊。。。lammps这个if命令不强大啊。...

在循环体内加一句print 同步打印循环变量和y的数值
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5楼2013-04-03 17:05:08
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zhang_jaj

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by weihai203 at 2013-04-03 17:05:08
在循环体内加一句print 同步打印循环变量和y的数值...

关键问题是这个y的值不能随着if条件判断正确而自加1，太麻烦了，我编程解决去了。
谢谢了
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6楼2013-04-03 21:45:51
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gswylq

木虫 (正式写手)
兄弟，这个问题解决了吗？我也正在弄，可是就是不行，好像是$x == 12 这一步不能比较.总是报错Substitution for illegal variable，你是怎么解决的啊？
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7楼2013-09-13 14:09:07
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zhang_jaj

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by gswylq at 2013-09-13 14:09:07
兄弟，这个问题解决了吗？我也正在弄，可是就是不行，好像是$x == 12 这一步不能比较.总是报错Substitution for illegal variable，你是怎么解决的啊？

最后编程解决的
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8楼2013-09-14 07:54:42
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gswylq

木虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by zhang_jaj at 2013-09-14 07:54:42
最后编程解决的...

我也没办法了，只有编程了。
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9楼2013-09-14 10:56:00
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yanyxy

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by zhang_jaj at 2013-09-14 07:54:42
最后编程解决的...

请问你用什么程序编的程
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10楼2015-05-25 16:00:49
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