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321wangke321

金虫 (正式写手)

[求助] 求高人指点提交EST序列问题

本人在克隆到核心片段后做了3race,测序得到的序列想上传。尝试用sequin上传,但是老外说有序列移码现象。我该肿么办啊,着急?
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王者风范,一切皆有可能。
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niil

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
321wangke321: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-03-27 17:04:35
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-04-27 14:27:37
可能是你序列拼接的过程中出现了些问题,可能是由于没有剔除掉测序质量差的序列导致了最终的得到的序列有插入或者缺失,从而造成了移码。
如果以上情况没有的话,那最好在产生移码的位点两侧设计一对引物,克隆出片段之后测序验证这段序列。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

Stop fighting,let it flow.
2楼2013-03-27 15:46:33
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321wangke321

金虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by niil at 2013-03-27 15:46:33
可能是你序列拼接的过程中出现了些问题,可能是由于没有剔除掉测序质量差的序列导致了最终的得到的序列有插入或者缺失,从而造成了移码。
如果以上情况没有的话,那最好在产生移码的位点两侧设计一对引物,克隆出片 ...

谢谢哈
王者风范,一切皆有可能。
3楼2013-03-27 17:04:14
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