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关于platon和cif文件
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在用diamond画图时，经常涉及到氢键和pi-pi堆积等东西，但是在diamond里边一个一个地找氢键，实在是非常费事，有时候找一个数据的氢键得花一天的时间，还不见得能找对。请问大牛： 能不能在cif文件里边写入氢键数据和pi-pi堆积的数据，然后直接在diamond中，就可以自动画出来氢键了？ 虽然金币只是一种心意，没有实际用途，但是我还是先拿出100个略表心意，要是哪位朋友能帮我解决这个问题，我将为您单独奉上100金币以表感谢！如果我的问题不够清晰的话，您可以站内信给我。谢谢！！ |
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lin_twins
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3楼2013-03-24 23:52:18
luxtal
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2楼2013-03-24 22:56:01
p452_1
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
平和必取: 金币+10, ★★★很有帮助, 请问能具体点儿吗，有没有相应的教程或者说明？有的话，麻烦您给一点儿。上面两位朋友的建议也很好，但是在diamond里操作，我会的，但是想尝试直接在cif文件里写入的新方法。 2013-03-25 16:28:35
感谢参与，应助指数 +1
平和必取: 金币+10, ★★★很有帮助, 请问能具体点儿吗，有没有相应的教程或者说明？有的话，麻烦您给一点儿。上面两位朋友的建议也很好，但是在diamond里操作，我会的，但是想尝试直接在cif文件里写入的新方法。 2013-03-25 16:28:35
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首先可以在cif文件中写入氢键数据。具体方法是在lst文件中查到氢键列表和相应的对称操作，然后在最新的ins文件中通过加入EQIV和HTAB等2个命令把所有的氢键写出来，存好文件，再做refinement，这样新产生的cif文件就会被自动写入氢键数据。 例如，这2个命令的具体使用如下： EQIV $1 x y-1 z HTAB O1w O8_$1 ........ 这样列出在Lst文件中出现的所有的氢键。 在diamond中，你可以根据cif文件（或者Lst文件，或者生成的晶体数据表格的Word文件）中的氢键列表展示出的氢键最小和最大的距离和角度，进行手动设置这些参数。这样就可以画出来符合cif文件中氢键数据和数量的氢键出来了。 |
4楼2013-03-25 04:27:35
gongwei924
金虫 (正式写手)
九五之尊
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5楼2013-03-25 17:07:04
