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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 请教：如何获得未知病毒的基因组？
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malstose

金虫 (正式写手)

[交流] 请教：如何获得未知病毒的基因组？

先请教下各位虫友，如何获得未知病毒的基因组呢？比如肯定在一个样品里面存在一种病毒，用何种方法获得其全基因组呢？
测序的话，应该拿什么去测序？
先谢谢啦！
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1楼 2013-03-23 16:30:51
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niil

金虫 (正式写手)
★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励应助交流！ 2013-03-26 04:24:44
引用回帖:
14楼: Originally posted by malstose at 2013-03-25 18:44:19
谢谢！但DNA序列不清楚，如何构建组文库？...

这个需要做些预实验看看。
首先确定这是DNA病毒。
然后富集病毒得到足量的DNA。
使用多种限制性内切酶酶切，让后电泳看看。优选酶切图谱条带丰富的。
然后可以进行文库构建。
选择2-3种限制性内切酶分别酶切足量的病毒DNA。
利用每种限制性内切酶的酶切产物分别构建DNA文库。（如果感觉DNA量不多，那最好加接头，然后PCR扩增之后再建库）
每个文库筛鉴定出合适的克隆进行测序。
最后将得到的测序结果根据片段重叠区进行组装，得到完整的病毒DNA序列。
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17楼2013-03-25 20:52:30
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zxd95

至尊木虫 (著名写手)
★ ★
malstose(金币+1): 谢谢参与
malstose(gyesang代发): 金币+1, 鼓励发贴交流，为楼主问题解决提供可能的线索！ 2013-04-27 14:54:58
全基因组测序，这是最好的方法！基因组小，应该花不需要太多钱！

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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3楼2013-03-23 20:41:07
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zxd95

至尊木虫 (著名写手)
全基因组测序，这是最好的方法！基因组小，应该花不需要太多钱！

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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4楼2013-03-23 20:41:24
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zhibao214

金虫 (小有名气)
★
malstose(金币+1): 谢谢参与
用小RNA测序也可以啊
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5楼2013-03-24 09:08:51
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