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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 又是一个问题，关于二面角的？？？
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zhl1987091

木虫 (小有名气)

[求助] 又是一个问题，关于二面角的？？？

我做聚合物扭转角分析，不会做，在小木虫找到了这个（如图一），我就依样做下去，然后又遇到了这个（如图二），都是前人遇到过的，我该怎么办？？求指导！

QQ截图20130320094101.png



QQ截图20130320094116.png
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追求卓越
1楼2013-03-20 09:43:43
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zhl1987091

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by arthurii at 2013-03-20 15:39:32
用DS算二面角很简单的，直接在界面就可以定义，建议直接算的话，用structure里面的monitor的二面角，或者可以看看analysis的模块里面的分析。

我怎么没有找到啊？我用的是materials studio 软件，你呢？
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追求卓越
3楼2013-03-21 08:33:18
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zhl1987091

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by arthurii at 2013-03-21 13:48:29
没用过MS，我用的是DS，但是感觉都会有吧，这种很简单的选项诶

哦！
5楼2013-03-21 15:53:28
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zhl1987091

木虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★
chaizhm: 金币+5, 鼓励一下~ 2013-03-26 09:37:33
自己提问自己解答：

具体用到Find Patterns dialog。先从长链中copy出4个C相连的结构，放在一个新的文件3D Atomistic文件中，或者手动画4个C相连的结构，保存，命名为dihedral.xsd。用工具箱中measure torsion来测定这4个C的dihedral angle的值，此时dihedral.xsd中出现torsion的值。保存dihedral.xsd，并选中这个dihedral的值，注意不要选择上原子。

调换到要测量dihedral angle的文件或者轨迹文件，用edit-->find pattens。在pattern document里选择dihedral.xsd，在match property里选择elementType，点击Find。然后所有含4个C的二面角的值都计算出来了，这需要时间。

用forcite-->analysis，此时按预设值， 点analyze即可，不用选择sets项，然后就会出来dihedral angle的分布图
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追求卓越
6楼2013-03-25 22:09:16
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