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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 关于分子动力学的一些问题，恳请各位赐教
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jinlong8937

金虫 (小有名气)

[交流] 关于分子动力学的一些问题，恳请各位赐教

大家好，本人第一次接触分子动力学，在看了一些文献资料后，有两个问题想请教下各位~
第一、为什么分子动力学做拉伸时的应变率都很高，我看文献中是10^10/s，这与宏观试验的应变率相差很大，如果想将应变率降低的话，是不是对硬件要求很高？
第二、关于周期性边界条件的问题，既然选用了PBC，为什么有学者初始模型还是选择10倍或者100倍单胞，不是已经都无限重复了吗？
新手恳请各位不吝赐教！
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1楼 2013-03-18 16:11:51
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韩欢欢

金虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你好，我想请教一下，在做恒温拉伸的时候需要加什么系综?
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7楼2013-07-15 21:30:53
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chaizhm

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
jinlong8937: 金币+2 2013-03-18 18:08:19
1. 分子动力学做拉伸，有个问题需要考虑，怎么保证恒定的拉伸力。我不知道你是怎么保证的，如果搞定这个，你的问题大概就解决了

2. 分子动力学基本原理是统计平均，理论上来说体系越大，算的越准，但是体系无限大的话，计算时间太长，所以选定一个足够大的体系。选用周期性边界条件，就是为了模拟无限大体系
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2楼2013-03-18 16:28:42
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huai

木虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
jinlong8937: 金币+2, 受益匪浅 2013-03-18 19:39:43
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-03-18 20:17:22
分子动力学的周期性边界条件与第一性原理的周期性边界条件是不一样的。分子动力学研究的体系的大小就是模拟的box里面的原子，原子数目越多，热涨落越小。分子动力学研究的问题有很多都是非周期的：比如位错，晶界，拉伸等等。周期性边界条件的引入只是为了消除它的表面效应。如果你不想用周期性边界条件，那么你模拟的体系可以看成是一堆原子形成的团簇或链。
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3楼2013-03-18 19:17:03
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jinlong8937

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by chaizhm at 2013-03-18 16:28:42
1. 分子动力学做拉伸，有个问题需要考虑，怎么保证恒定的拉伸力。我不知道你是怎么保证的，如果搞定这个，你的问题大概就解决了

2. 分子动力学基本原理是统计平均，理论上来说体系越大，算的越准，但是体系无限大 ...

谢谢，另外，为什么分子动力学里的应变率都如此之高呢？
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4楼2013-03-18 19:34:45
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