| 查看: 7604 | 回复: 6 | ||
[求助]
用lammps运算，出现 Bond atoms missing错误，是怎么回事？
|
|
我先用MS搭建结构，经过结构优化后，导到lammps进行运算。老出现“ERROR on proc 0: Bond atoms 534 535 missing on proc 0 at step 384 (neigh_bond.cpp:55)". lammps手册解释是Bond atoms %d %d missing on proc %d at step %ld。 One or both of 2 atoms needed to compute a particular bond are missing on this processor. Typically this s because the pairwise cutoff is set too short or the bond has blown apart and an atom is too far away. 但是我的pairwise cutoff 为12。这两个原子的距离为1.68，我用harmonic公式，平衡距离设置为1.64.请问到底哪里出问题？请大家帮帮忙，谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
OpenAI又攻克数学难题了，离AI做有机合成还有多远？
已经有12人回复
-
极限拉扯，如何抉择
已经有13人回复
-
课题组会帮你通过考核么？
已经有7人回复
-
入职后第一次管课题组的专利缴费，对账才发现官费比别人多掏了一倍
已经有6人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有9人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有8人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有10人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有9人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有7人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有10人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- lammps 离子液体，离子中相邻隔的挺远的原子成键了，不知什么原因
已经有8人回复
- 关于lammps中的in文件运行时的错误问题查找
已经有10人回复
- LAMMPS中meam势无法调用
已经有10人回复
- LAMMPS运行结果出现nan
已经有20人回复
- 有用lammps模拟过聚合物的相关性能吗？
已经有12人回复
- 在Lammps中安装xmovie工具时，Makefile文件怎么修改X库路径
已经有3人回复
- LAMMPS Error:lost atoms
已经有7人回复
- Ubuntu 编译Lammps 单机串行错误，帮帮忙
已经有5人回复
- 【求助】LAMMPS运行错误：Out of range atoms - cannot compute PPPM
已经有7人回复
- 【讨论】编译lammps时Makefile的修改问题
已经有8人回复
ddll_slsl
木虫 (正式写手)
- 应助: 101 (高中生)
- 金币: 2939.2
- 红花: 6
- 帖子: 670
- 在线: 255.3小时
- 虫号: 2121784
- 注册: 2012-11-12
- 专业: 动力学与控制
2楼2013-03-22 09:06:38
dswkohaku
木虫 (小有名气)
- 应助: 19 (小学生)
- 金币: 1844.5
- 红花: 1
- 帖子: 234
- 在线: 352.2小时
- 虫号: 843976
- 注册: 2009-09-09
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
3楼2013-05-10 04:07:54
liuasia
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 102.6
- 散金: 200
- 帖子: 69
- 在线: 122.6小时
- 虫号: 3001880
- 注册: 2014-02-27
- 性别: GG
- 专业: 艺术美学
4楼2014-04-09 20:39:25
tina张5楼2014-04-11 08:27:41
liuasia
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 102.6
- 散金: 200
- 帖子: 69
- 在线: 122.6小时
- 虫号: 3001880
- 注册: 2014-02-27
- 性别: GG
- 专业: 艺术美学
6楼2014-04-11 08:57:19
tina张
新虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 362.5
- 散金: 10
- 帖子: 118
- 在线: 190.9小时
- 虫号: 3710260
- 注册: 2015-03-04
- 性别: MM
- 专业: 金属材料的磨损与磨蚀
7楼2016-11-26 11:19:51
