24小时热门版块排行榜    

查看: 2792  |  回复: 11

luomia

木虫 (著名写手)


[交流] 在VMD中通过不同的平面选择原子

将dump文件导入VMD之后,可以设置不同的条件选择原子。初步想法是通过鼠标选择其中的3个原子(构成一个平面),选择平面上/下的原子部分,可以更方便观察内部结构。

即步骤:
1.获取鼠标选择的3个原子坐标
2.通过计算,得到平面参数
3.设定选择平面上/下的原子

步骤2,3没有问题,但不知道如何能得到鼠标选择的原子信息。VMD中有个鼠标模式pick可以将选择的单个原子信息(包含坐标)输出到屏幕,谁能说一下这个pick调用的函数在安装文件的什么地方。或者如何编程在tcl中得到鼠标的位置信息。
请大家支支招。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

VMD 软件

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luomia

木虫 (著名写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by tangbohejin at 2013-03-13 09:52:48

汗,纯表
3楼2013-03-13 11:38:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Amaximan

铁杆木虫 (职业作家)



luomia(金币+1): 谢谢参与
我是来学习的哦
5楼2013-03-13 12:21:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
6楼2013-03-13 12:24:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhang_jaj

木虫 (正式写手)



luomia(金币+1): 谢谢参与
支持这种创新的想法和实现,学习
7楼2013-03-13 19:07:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luomia

木虫 (著名写手)


引用回帖:
7楼: Originally posted by zhang_jaj at 2013-03-13 19:07:49
支持这种创新的想法和实现,学习

我试过一步步导入的方法,先pick从屏幕上得到三个点坐标值,再导入matlab计算平面参数,然后回到vmd选择原子,结果是可以实现的。但这个过程繁琐,如果要选择多组平面是不方便的。这里面的难点就是如何通过tcl得到鼠标的信息。pick应该也是通过调用内部函数实现的,只是不晓得这个函数的位置。
10楼2013-03-13 20:42:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
2013-03-13 09:52   回复  
luomia(金币+1): 谢谢参与
zhihaikou4楼
2013-03-13 12:03   回复  
luomia(金币+1): 谢谢参与
祝福
yelin19898楼
2013-03-13 19:21   回复  
luomia(金币+1): 谢谢参与
2013-03-13 19:52   回复  
luomia(金币+1): 谢谢参与
假大空11楼
2013-03-13 21:06   回复  
luomia(金币+1): 谢谢参与
haixiawu12楼
2013-03-19 06:12   回复  
相关版块跳转 我要订阅楼主 luomia 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国自然评审意见 +7 wangmingqi 2026-08-28 8/400 2026-08-28 18:42 by zhuzg0628
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +11 Kittylucky 2026-08-27 12/600 2026-08-28 16:26 by lyxiaomc
[基金申请] 基金不中,共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +4 gdd2018 2026-08-28 9/450 2026-08-28 14:22 by jklily
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +3 bud_bud 2026-08-27 6/300 2026-08-28 11:53 by bud_bud
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
信息提示
请填处理意见