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machao8405

木虫 (正式写手)

[求助] 荧光定量如何安排样品

小弟最近在做荧光定量PCR,5个不同处理,12个取样时间,2个器官,还要做内参及重复,如何安排实验才能减小,每板之间对结果的误差?
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hy_sandra

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
machao8405: 金币+2 2013-03-13 18:04:36
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科研是無止盡的
2楼2013-03-12 23:13:09
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2013-03-13 16:39:01
machao8405: 金币+2 2013-03-13 18:04:41
提好的RNA最好同时测浓度后反转录,反转录时要做master mix,这样避免不同时间反转的cDNA造成误差。此外,如果是做相对定量的话,同一样品的目的基因和内参一定要同时跑。如果做绝对定量,板与板之间要做内标。
3楼2013-03-12 23:54:06
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machao8405

木虫 (正式写手)

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2?: Originally posted by hy_sandra at 2013-03-12 23:13:09
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4楼2013-03-13 08:22:19
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machao8405

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-03-12 23:54:06
提好的RNA最好同时测浓度后反转录,反转录时要做master mix,这样避免不同时间反转的cDNA造成误差。此外,如果是做相对定量的话,同一样品的目的基因和内参一定要同时跑。如果做绝对定量,板与板之间要做内标。

不同时间点的样品,不在同一板跑影响大不大呢?
5楼2013-03-13 08:23:16
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
machao8405: 金币+2 2013-03-13 18:04:53
引用回帖:
5楼: Originally posted by machao8405 at 2013-03-13 08:23:16
不同时间点的样品,不在同一板跑影响大不大呢?...

板与板之间是可能造成一定差别,做相对定量的话问题不大。
6楼2013-03-13 10:20:03
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hy_sandra

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by machao8405 at 2013-03-13 08:22:19
内参跟目的基因不在一板做应该就失去内参的意义了吧?...

內參是確保樣本之間模版?舛鹊牟町?性,與目的基因沒有關聯,所以我是覺得不在一起作也沒關係。除非你用了tagman primer設計內參,?K與目的基因在同一管內作用,這樣就可以更使loading error減小,誤差就更小了
科研是無止盡的
7楼2013-03-13 16:28:31
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