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DGGE切胶回收测序多个条带是同种菌或所有条带都是同种菌是怎么回事？
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各位前辈，得出DGGE图谱后切胶回收测序，用过直接PCR测序，也用过克隆测序，发现多个条带的测序结果都是一种菌。我听说两三个条带是一种菌的现象，但是五六个条带都是同一种，甚至整个图谱分离的条带都是一种菌，实在有些夸张。着急啊~不知到底什么原因。 比如下图中，2、3、4号是同一种（距离比较近，尚且能理解），1、8、12是同一种，6、9、10、11、14是同一种，最后导致整个图里就四五种细菌。  使用的PCR引物是341F-GC/518R，DGGE变性梯度是40-65%，180V，4.5h，测序方法是克隆测序。 还另外做过一组，其他条件一样，测序是直接PCR测序，结果更壮烈，所以条带都是一种菌。  求教求教~  haoyang.JPG |
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leichenliu
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4楼2013-03-11 10:34:46
