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shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)

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[求助] CCDC索取的MOF的cif文件导入到MS中后显示的结构与文献中的不一致

最近向CCDC那边索要了一个ZIF-7的cif文件，但是在导入MS后发现结构与文献中的相差很大，而且有很多不合理的地方。一开始导入的时候结构中各个原子并没有成键，我用calculate bonds的功能让其成键，成键后发现里面有一些水分子存在，我将这部分原子删除后，又发现结构中的苯环和咪唑有问题，两个苯环或咪唑或者共用其中的两个原子，并呈一定角度，如下图所示。向大家请教一些，这种从CCDC中导入的结构应该怎么处理才能时其与文献报道的一致呢？
cif文件链接：
http://good.gd/2458964.htm
图片2.png

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附件 1 : zif-7.cif

2013-03-08 10:32:15, 14.48 K

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1楼 2013-03-08 10:33:03

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shiyiwenren

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引用回帖:

2楼: Originally posted by cg陈 at 2013-03-08 16:39:37
你看下你的文献关于这个结构所引用的参考文献是否与你CCDC中结构的参考文献一致？

Huang, X.; Zhang, J.; Chen, X. [Zn(bim)2]·(H2O)1.67: A Metal-Organic Open-Framework with Sodalite Topology.Chin. Sci. Bull.2003,48, 1531–1534
我从CCDC索取结构的时候用的是这篇文献。