24小时热门版块排行榜    

查看: 3450  |  回复: 22
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)

[求助] CCDC索取的MOF的cif文件导入到MS中后显示的结构与文献中的不一致

最近向CCDC那边索要了一个ZIF-7的cif文件,但是在导入MS后发现结构与文献中的相差很大,而且有很多不合理的地方。一开始导入的时候结构中各个原子并没有成键,我用calculate bonds的功能让其成键,成键后发现里面有一些水分子存在,我将这部分原子删除后,又发现结构中的苯环和咪唑有问题,两个苯环或咪唑或者共用其中的两个原子,并呈一定角度,如下图所示。向大家请教一些,这种从CCDC中导入的结构应该怎么处理才能时其与文献报道的一致呢?
cif文件链接:
http://good.gd/2458964.htm
图片2.png
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : zif-7.cif
  • 2013-03-08 10:32:15, 14.48 K

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ter20 at 2013-03-11 09:16:04
试试用chemcraft或者gaussview

我这边没有这两种软件,也没有用过。不知道你电脑里有没有,如果有的话,麻烦你帮我看下,我已经将cif文件上传到网盘了,谢谢
4楼2013-03-11 14:12:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 23 个回答

cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
shiyiwenren: 金币+3 2013-03-11 14:14:26
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-03-12 08:18:08
你看下你的文献关于这个结构所引用的参考文献是否与你CCDC中结构的参考文献一致?
2楼2013-03-08 16:39:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ter20

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
shiyiwenren: 金币+3 2013-03-11 14:12:19
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-03-12 08:17:58
试试用chemcraft或者gaussview
3楼2013-03-11 09:16:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cg陈 at 2013-03-08 16:39:37
你看下你的文献关于这个结构所引用的参考文献是否与你CCDC中结构的参考文献一致?

Huang, X.; Zhang, J.; Chen, X. [Zn(bim)2]·(H2O)1.67: A Metal-Organic Open-Framework with Sodalite Topology.Chin. Sci. Bull.2003,48, 1531–1534
我从CCDC索取结构的时候用的是这篇文献。
5楼2013-03-11 14:14:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上合作单位盖章 +3 ssyjh 2026-08-27 3/150 2026-08-27 09:59 by 阿拉贡aragon
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +4 苏东坡二世 2026-08-23 4/200 2026-08-27 09:18 by 冥王篇
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 +7 晴天加油 2026-08-26 8/400 2026-08-27 07:53 by longfie172
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 04:33 by Ie9AyIAvGbvs
[基金申请] 系统查不到 +10 董八千 2026-08-26 10/500 2026-08-26 16:30 by Equinoxhua
[基金申请] 怎么查啊 +5 huang1991js 2026-08-26 5/250 2026-08-26 16:09 by Equinoxhua
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
信息提示
请填处理意见