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gromacs计算时原系统带电荷，如何添加离子中和电性？ 已有1人参与
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| 如题，在做gromacs时，提示系统带3个正电荷，怎么添加离子中和电性呢？谢谢各位啦。 |
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 Gromacs |
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spirte雷
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5楼2013-03-06 18:17:16
【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
lid5251: 金币+2, ★有帮助 2013-03-05 11:12:03
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lid5251: 金币+2, ★有帮助 2013-03-05 11:12:03
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多看手册 genion 命令即可 例如我要添加46个离子，使用下面的命令： genion -s em.tpr -o lions.gro -g add_ions.log -pname NA+ -np 46 -p mono.top -random -seed 1993 如果你是初学者，推荐你下载一个GROMACS_MD_Flowchart.pdf http://ishare.iask.sina.com.cn/f/15271185.html 再把论坛里的入门教程顺着做一遍，你就会很熟悉了。 记得多读手册 |
2楼2013-03-05 10:10:07
3楼2013-03-05 11:12:56
4楼2013-03-05 14:10:14
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