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江诚1990

金虫 (小有名气)

[求助] Amber matrix correl求助

Sample Text我在做一个分子的correlation,用的是Amber,命令如下:matrix correl mask1 mask2 out filename bymask
结果不应该只是mask1和mask2的一个相关性数据么?但我的输出结果却是三个数据,而且第一个数据非常大,达到了10几位,后面两个比较像相关性的数据,是0.几。请假大神,这三个数据代表的是什么意思?matrix correl是如何输出的?
我用byatom得到的结果是个矩阵,跟我预期的一样,就是每两个原子之间的相关性,但进行了很多组,竟然没有出现负相关的,这个也比较奇怪

C7(V}@CUOEI@(9~K$CQC~I2.jpg
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天道酬勤
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江诚1990

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 小蜗牛8728 at 2013-03-08 00:41:12
推荐你看看amber9的manual.这个里面也包括了tools。
...

嗯,看的就是AmberTools15,算了,没人回,自己编了
天道酬勤
6楼2013-03-13 18:36:10
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江诚1990

金虫 (小有名气)

在线等答案啊,有人回么?
天道酬勤
2楼2013-03-04 18:15:51
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匿名

用户注销 (正式写手)

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-03-05 10:11:23
本帖仅楼主可见
3楼2013-03-04 23:37:35
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匿名

用户注销 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
江诚1990: 金币+5, 有帮助, 看了AmberTools15,感觉这部分讲的很少 ,输出文件的部分也没有讲清楚。。。 2013-03-05 09:37:11
本帖仅楼主可见
4楼2013-03-04 23:37:45
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