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witeness

新虫 (初入文坛)

[求助] pET28a双酶切后连接目的基因,什么也不长。。。

1.pET28a提出来时分子量就很大,8kb左右,不知道为什么提出来的质粒分子量就狠大,但双酶切后在5.5kb左右。见电泳图:左边到右分为为:marker(三条亮带分别为6000 3000 1000) 双切后质粒 未酶切的质粒 双切后的目的基因(1.5kb)
2.我用SacI和HindIII双酶切,体系20ul,10*tango buffer 2ul,质粒DNA 16ul,SacI 1ul,HindIII 1ul.切出来的条带在5.5kb左右。目的基因是从T载体上切下来的,20ul体系和质粒双酶切一样,就把质粒DNA换成目的基因16ul.电泳显示是切开了的。37度酶切6小时。
3.10ul的连接体系:目的基因7ul,载体1.5ul,10*buffer 1ul,T4连接酶 0.5ul.4度过夜连接,什么也不长,我还设置了对照组,感受态组:什么也不转,长得很好,说明感受态没问题。质粒自连组:质粒 2ul,ddH2O 6.5ul,10*buffer 1ul,T4连接酶 0.5ul.什么也不长。双切后的线性质粒转化,5ul的线性质粒转化100ul感受态,也什么都不长。。。
重复好几次了都不长,快崩溃了。。。

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witeness

新虫 (初入文坛)

gyesang: 回帖置顶 2013-04-28 17:32:56
我的连接做出来了,在此分享下,希望能帮到遇到同样问题的同学
1.我的质粒提出来大小不对,可能就是构想不同的原因,虽然我前几次提的都是这么大,但有一次我提出来的质粒大小事对的,在5,6k左右。但之前分子量大的质粒不影响后续试验
2.我之前一直连接不上市因为我的片段浓度都太小了,双酶切完跑胶时条带也不是很亮,回收损失一部分就更少了,后来加大上样量,DNA片段浓度提高了,就连上了,虽然就长了两个菌落,但都是阳性的,呵呵,目前不知道为啥连接效率这么低,空质粒转感受态的效率很高,所以应该不会是感受态的问题。希望大侠们帮我分析下原因,接下来还要连第二个基因,不想连接效率还是这么低啊
无论怎样,只要连上就好
16楼2013-03-07 15:57:07
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piaoyunokok

木虫 (正式写手)

遇到类似的问题,求助啊
2楼2013-03-02 11:03:32
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
witeness(myprayer代发): 金币+2, 赠人玫瑰手有余香,鼓励应助,分子生物版块期待你的更多精彩。 2013-04-14 15:31:07
你做了很多对照,但是转化最关键的是需要做一个阳性对照和阴性对照。你把感受态什么都不转,涂的是无抗性的板子吧,否则不能长得很好。这个并不能说明感受态没问题,只能说明感受态细胞复苏得不错。是否具备感受性需要用感受态细胞转一个抗性相同的质粒,能转进去才说明感受态好用,这是我提到的阳性对照。阴性对照应该是感受态什么都不转涂抗性板,说明感受态细胞没有污染,抗性平板筛选压力足够。
我有些不明白你说的质粒自连是什么。质粒肯定可以转进去的,即使加了连接酶什么的,并不影响后面的转化。做这个对照的意义是什么呢?
对于线性载体,有人做这个对照,一般是把双酶切的线性载体自连后转化。如果出现很多克隆,说明酶切不完全。

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3楼2013-03-02 13:20:24
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


witeness(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香。期待你的慷慨解囊。快乐每一天 2013-04-15 09:49:13
你提的质粒“分子量很大”是质粒的构象问题,你不是用盒子提的吧?你的这种情况,很可能主要是开环构象。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2013-03-02 13:22:25
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