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ccsthg

新虫 (初入文坛)

[求助] 新手求助

弱弱的问一句，mRNA的CATG位点代表什么，是转录的起始位点吗？
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1楼 2013-02-25 09:41:32
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peakg7

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
不代表什么吧，不是起始位点也是是catg吧，查找起始位点，去查一下就知道了
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2楼2013-02-25 12:32:11
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yuanbo934

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
ATG翻译起点。mRNA不仅包括ORF也可能包括5‘非翻译区和3‘非翻译区，所以CATG不能说明什么，5‘cap是后加上去的。
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3楼2013-02-25 21:31:09
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ccsthg

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by yuanbo934 at 2013-02-25 21:31:09
ATG翻译起点。mRNA不仅包括ORF也可能包括5‘非翻译区和3‘非翻译区，所以CATG不能说明什么，5‘cap是后加上去的。

我在资料上看到这样一句话“利用软件检索mRNA上所有的CATG位点，生成CATG+17nt碱基的参考标签数据库”，意思是不是所有的标签都应该是以CATG开头啊？
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4楼2013-02-26 09:42:49
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ccsthg

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by peakg7 at 2013-02-25 12:32:11
不代表什么吧，不是起始位点也是是catg吧，查找起始位点，去查一下就知道了

谢谢！
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5楼2013-02-26 09:43:04
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ccsthg

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by peakg7 at 2013-02-25 12:32:11
不代表什么吧，不是起始位点也是是catg吧，查找起始位点，去查一下就知道了

还想再问一下，blast nr具体是什么意思啊？
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6楼2013-02-26 09:43:52
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ccsthg

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by yuanbo934 at 2013-02-25 21:31:09
ATG翻译起点。mRNA不仅包括ORF也可能包括5‘非翻译区和3‘非翻译区，所以CATG不能说明什么，5‘cap是后加上去的。

还想问一下，blast nr 具体什么意思啊？
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7楼2013-02-26 09:44:15
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yuanbo934

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

nr是NCBI里的非冗余蛋白数据库，我们可以用自己的query序列，blast搜索这个数据库，得到这些query序列的具有序列相似性的蛋白序列。
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8楼2013-02-26 14:50:50
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