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新虫 (初入文坛)

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弱弱的问一句,mRNA的CATG位点代表什么,是转录的起始位点吗?
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peakg7

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
不代表什么吧,不是起始位点也是是catg吧,查找起始位点,去查一下就知道了
2楼2013-02-25 12:32:11
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yuanbo934

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
ATG翻译起点。mRNA不仅包括ORF也可能包括5‘非翻译区和3‘非翻译区,所以CATG不能说明什么,5‘cap是后加上去的。
3楼2013-02-25 21:31:09
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ccsthg

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by yuanbo934 at 2013-02-25 21:31:09
ATG翻译起点。mRNA不仅包括ORF也可能包括5‘非翻译区和3‘非翻译区,所以CATG不能说明什么,5‘cap是后加上去的。

我在资料上看到这样一句话“利用软件检索mRNA上所有的CATG位点,生成CATG+17nt碱基的参考标签数据库”,意思是不是所有的标签都应该是以CATG开头啊?
4楼2013-02-26 09:42:49
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ccsthg

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by peakg7 at 2013-02-25 12:32:11
不代表什么吧,不是起始位点也是是catg吧,查找起始位点,去查一下就知道了

谢谢!
5楼2013-02-26 09:43:04
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ccsthg

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by peakg7 at 2013-02-25 12:32:11
不代表什么吧,不是起始位点也是是catg吧,查找起始位点,去查一下就知道了

还想再问一下,blast nr具体是什么意思啊?
6楼2013-02-26 09:43:52
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ccsthg

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by yuanbo934 at 2013-02-25 21:31:09
ATG翻译起点。mRNA不仅包括ORF也可能包括5‘非翻译区和3‘非翻译区,所以CATG不能说明什么,5‘cap是后加上去的。

还想问一下,blast nr 具体什么意思啊?
7楼2013-02-26 09:44:15
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yuanbo934

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

nr是NCBI里的非冗余蛋白数据库,我们可以用自己的query序列,blast搜索这个数据库,得到这些query序列的具有序列相似性的蛋白序列。
8楼2013-02-26 14:50:50
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