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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 蛋白质大小的计算
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jasminezhao

金虫 (小有名气)

[交流] 蛋白质大小的计算 已有4人参与

先请教一下各位高手蛋白质的大小怎么求？已知该蛋白质的长为1389aa，相对分子质量为114718.07m.w.,怎么转化成多少KD啊？有的人说，用1389/3*110，还有的人说114718.07/1000及转换成KD。可是为什么两个计算方法的结果不一样呢？希望各位大侠指点迷津！！
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1楼 2013-02-18 19:40:34
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jasminezhao

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 东方龙飞 at 2013-02-20 17:43:26
http://web.expasy.org/compute_pi/ 是可以用来计算分子量和等电点 前体是你必须知道全基因或者全氨基酸的序列
用1389/3*110  是根据氨基酸的量来算平均分子量
114718.07/1000及转换成KD 是相对精确的算法，但也还 ...

用1389/3*110方法算最后结果约为51KD,而用114718.07/1000方法算结果约为115KD，其实我最不明白的是为什么两种算法差值会有这么大。还有一个就是做完western blot 之后跑的胶都能分别看到这两个大小的泳道，所以我就不知道我的蛋白大小到底应该是哪个。谢谢！！麻烦帮忙解答一下！
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7楼2013-02-20 18:19:52
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robustli

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小丹木木: 金币+2, 鼓励 交流 2013-02-20 17:05:19
the former one is the average or raw molecular weight, the second one  should be the relatively accurate molecular weight
you can also use this  website to calculate the MW
赞一下(1人) 回复此楼
immunologyparasite
2楼2013-02-18 22:10:23
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jasminezhao

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by robustli at 2013-02-18 22:10:23
the former one is the average or raw molecular weight, the second one  should be the relatively accurate molecular weight
you can also use this  website to calculate the MW

Thank u for ur help,but I want to know wherer is the website u methioned.
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2013-02-19 08:36:37
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robustli

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
http://web.expasy.org/compute_pi/
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immunologyparasite
5楼2013-02-19 21:56:19
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