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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 如何画这样一个图形，用的什么软件 了。
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betty920

新虫 (小有名气)

[求助] 如何画这样一个图形，用的什么软件 了。

请教各位学生物的朋友，如何画这样一个图形，用的什么软件，我看很多paper里都有出来，谁能给我点建议，谢谢了。

真的很想学习，特来请教。我有类似的数据，知道的老师同学，教 教我呀~

LIG}I4R6@[`P3_PRWDUKZW3.jpg
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1楼 2013-02-15 08:23:26
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keydy

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
amisking: 金币+2, 鼓励发帖交流问题。 2013-02-15 19:02:51
我来提供一个软件：phylip
另外，还有：ClustalX
你可以尝试一下，有汉化版，使用也非常简单
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2楼2013-02-15 11:38:27
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洛神大炳

铁杆木虫 (著名写手)

人才

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
试试 phylip吧，应该可以用
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多出成果！多出文章！
3楼2013-02-15 14:10:10
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ws59188

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
推荐phylip啊,试试看吧

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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4楼2013-02-15 14:56:38
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
用cluster聚类分析之后，用TreeView输出这种图像
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5楼2013-02-15 15:05:58
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yyll1988

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
stanford 的 cluster 3.o
使用 treeview 输出 （需要java环境），
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6楼2013-02-16 01:08:12
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Arrennew

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
R软件可以，下载安装后用以下程序：

all<-read.csv("chip.csv",header=TRUE,sep=",",quote="",comment.char="#" #把数据输入excel里保存成.csv格式，放到软件安装文件夹，chip是名字可以自己改，all 是数据名称不用改
row.names(all) <- all$Name   #把行号换成行名
all <- all[,-1]   #去掉第一列
all_matrix <- data.matrix(all)  #把 data frame 转化为矩阵格式
heatmap(all_matrix, revC=FALSE,scale='column')   # 使用Rowv=NA, Colv=NA 设置聚类
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betty920
生命不息，探索不止。
7楼2013-02-17 16:31:54
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betty920

新虫 (小有名气)
送鲜花一朵
内容已删除
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8楼2013-02-18 10:32:36
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betty920

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by Arrennew at 2013-02-17 16:31:54
R软件可以，下载安装后用以下程序：

all<-read.csv("chip.csv",header=TRUE,sep=",",quote="",comment.char="#" #把数据输入excel里保存成.csv格式，放到软件安装 ...

你能加我QQ吗？491805841.我下了R软件，但我的数据太大了。怎么弄也不对。你能帮我了一下吗？
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9楼2013-02-18 12:04:27
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落雪唯舞

新虫 (初入文坛)
如果要画流程一般用的是coreldraw。如果你要是画质粒图谱，可以用simvector或是NTI。如果是设计primer可以用Primer
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10楼2013-02-27 22:42:50
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