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schalke

至尊木虫 (著名写手)

[求助] 请问IRC跑出来的反应物与优化的反应物不同怎么办?

模拟Diels-Alder反应机理,首先构造产物,产物优化之后将两个生成键拉长作为初猜结构,开始优化过渡态并进行频率验证,得到其有且只有一个虚频后用作IRC计算,两个方向分别得到在该反应路径上的产物和反应物,但用IRC得出的产物和反应物再进行优化,构象改变很大,这该如何解释?是不是IRC显示的反应物和产物并不是最低能量构型?
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meteoric30

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
schalke: 金币+2, 有帮助, 谢谢 2013-02-14 03:47:57
可能存在中间体 反应前有络合  查文献吧
3楼2013-02-14 00:16:10
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查看全部 5 个回答

lihe_m9

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
schalke: 金币+3, ★★★很有帮助, 谢谢指点,请问如何设置条件才可能获得最接近产物和反应物构象呢? 2013-02-14 03:47:13
gmy1990: 金币+2 2013-02-28 22:18:22
在你给定条件下,它找到了低点,它就完成了任务。
在你给定的条件之外,是否还有更低的点,它就不管了。
2楼2013-02-13 22:06:28
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lihe_m9

木虫 (著名写手)

最好是把可能的构型都做一做,之后再确定。不是一次就成功的。
4楼2013-02-14 09:06:05
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lihe_m9

木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lihe_m9 at 2013-02-14 09:06:05
最好是把可能的构型都做一做,之后再确定。不是一次就成功的。

一次的结果不可靠。
5楼2013-02-14 09:08:29
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