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汕头大学海洋科学接受调剂
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paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] lammps deposit 粒子初始速度为0?

大家新年好!
我最近在用lammps算金属表面喷涂,使用deposit命令,但是我按照说明设定了添加粒子的初速度,但是粒子速度一直为0,不运动。想请教下各位是什么原因?
我的in文件如下:
...
#Al为喷涂粒子type 2,Cu为基底 type 1,EAM势能,单位metal
...
region 4 block 0.0 72.3 0.0 72.3 210.0 225.0 side in units box  #设定添加粒子region,离基底Z方向距离20nm
...
group substrate region 1  #基底group
group al type 2    #喷涂的Al
...
compute 1 cuthermal temp
compute 2 cu temp
compute 3 al temp
compute_modify 3 dynamic yes
fix 1 substrate setforce        0        0        0  #基底fix
fix 2 cuthermal  nvt temp        300.0        300.0        10  #NVT恒温Cu
fix 3 cu  nve      #NVE恒定接触面
#fix 4 al  nve      #NVE恒定喷涂粒子,但是我尝试了有没有这条命令Al都没有运动
fix coat all deposit 10000 2 64 12345 region 4 near 5.0 vz -0.03 -0.03 units box    #deposit命令,是这有问题?

timestep   0.005  #fs
thermo     1000
thermo_style custom step temp ke pe etotal c_1 c_2 c_3
dump 1 all xyz 1000 metal.xyz
run 1000000
附图为计算结果,褐色粒子为Al,一直没有move,后续粒子一直添加到定义的region中。

谢谢大家!

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我是胖人,不是粗人
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paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-02-15 08:42:55
具体的只有靠你自己去摸索, 看dump等输出,仔细琢磨。 你的模型不算复杂,应该容易实现的。

Thanks! I will test it in the following days.
我是胖人,不是粗人
7楼2013-02-15 23:54:41
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paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-02-15 08:42:55
具体的只有靠你自己去摸索, 看dump等输出,仔细琢磨。 你的模型不算复杂,应该容易实现的。

请问喷涂粒子的group的该怎么定义?我用type或者region之类的定义,产生初始喷涂粒子group的粒子数为0,最终导致粒子不能运动。
我是胖人,不是粗人
8楼2013-02-16 06:02:15
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paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)

总结一下,
fix coat all deposit ......
不能对all进行fix,只能对喷涂粒子group进行fix,这样喷涂粒子就能单独积分运动了。
我是胖人,不是粗人
9楼2013-02-16 06:17:36
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普通回帖

ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
paladinlee: 金币+70, ★★★很有帮助, 10 2013-02-14 01:11:43
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2013-02-16 10:45:01
dump出原子速度看看?
2楼2013-02-13 17:47:07
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paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-02-13 17:47:07
dump出原子速度看看?

dump 喷涂粒子有初速度,但是不运动?怎么回事?
我是胖人,不是粗人
3楼2013-02-14 01:11:31
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

有初速度, 下一步骤的速度呢?
看看原子坐标, 有小小移动吗?
受力情况如何?
4楼2013-02-14 09:02:30
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paladinlee

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
zh1987hs: 金币+2, 鼓励交流 2013-02-16 10:45:26
引用回帖:
4楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-02-14 09:02:30
有初速度, 下一步骤的速度呢?
看看原子坐标, 有小小移动吗?
受力情况如何?

下一步还是保持原速度,粒子位置没动。
估计是粒子运动积分的group定义有问题。即(fix 4 al  nve)。但是我看说明没有要用到命令积分运动方程啊?
有没有什么方法让喷涂粒子的运动速度保持初速度,然后喷到基底表面的阶段半径内相互作用?
PS:如果对所有粒子all进行NVE积分的话,喷涂粒子有运动,但是运动太剧烈了,并且大部分在insert 的空间内运动,体系温度很高10000K...
我是胖人,不是粗人
5楼2013-02-14 23:41:15
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

具体的只有靠你自己去摸索, 看dump等输出,仔细琢磨。 你的模型不算复杂,应该容易实现的。

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6楼2013-02-15 08:42:55
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by paladinlee at 2013-02-16 06:02:15
请问喷涂粒子的group的该怎么定义?我用type或者region之类的定义,产生初始喷涂粒子group的粒子数为0,最终导致粒子不能运动。...

可以用不同的原子或分子类型。
10楼2013-02-16 21:01:35
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