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lingchaoju木虫 (小有名气)
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[求助]
求教关于PLS-DA，PCA之类的分类方法的载荷图筛选指标的原则
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我是个外行，但最近要用PLS-DA，PCA之类的分类方法来研究对不同香型物质进行分类指标的筛选，也就是从众多的品质指标中筛选出对不同香型区分具有重要贡献的品质指标，问题是：筛选的标准是什么？我看很多文章比如代谢组学中通过不同物质的NMR化学位移进行分析，然后从载荷图中看那些离原点最远，来作为区分不同组的重要指标。这个筛选化学位移的原则是什么？求教各位老师和虫友！或是有什么相关的书籍可以推荐也不甚感激！ 111.jpg  11111121.jpg |
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lingchaoju: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-01-29 09:30:41
感谢参与，应助指数 +1
lingchaoju: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-01-29 09:30:41
| 你列举的图中，PCA图中的得loading图（因子载荷图）筛选的是通过在主成分PC1和PC2中两个贡献率所占大小的程度的可视化表示，距离原点远的意思就是对PC1和PC2中贡献较大的差异性成分，而相反离原点近的对区分物质之间的差异区分度较小；PLS、PLS-DA是偏最小二乘算法，主成分PCA算法的不计算数据矩阵中物质之间的类别信息，而PLS等则可以结合数据矩阵中的变量Y，也就是物质之间的类别信息，进行筛选，相关的文献和书籍你可以多看看外文的文献和代谢组学学籍有好多，NMR在代谢组学的应用较为成熟，相关的多元统计分析方法的相关步骤都可以在外文书籍和文献中查到。希望对你有所帮助。 |
2楼2013-01-28 17:47:49
lingchaoju
木虫 (小有名气)
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3楼2013-01-29 09:33:25