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fayzhao

金虫 (小有名气)

[求助] 双酶切后切胶回收

各位虫友好:
目前,我正在做质粒双酶切,体系40ul:
dd水                       补足40ul
10Xtango buffer     4ul
质粒                       2ug
kpnI                        2ul
bglII                        2ul
37℃反应5h,电泳检测图如下:

目的是为了回收目的条带(300多bp),切胶回收用了takara的和axygen的,都没有回收到,跑胶没有任何条带。接下来我要做的是将目的基因连接到表达载体中,回收不到怎么办哪?求帮助!!!

2013-1-20双酶切_副本.jpg
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mascotte

金虫 (正式写手)

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★ ★
fayzhao: 金币+2 2013-01-30 14:14:55
看了你的实验结果,感觉你的酶切效率不高。kpnI 和Bgl II做双酶切时要同时考虑两种酶的活性,采用合适的buffer。fermentas的kpn I 酶活性并不高,并需要使用其公司特制的buffer,具体请见链接(http://www.thermoscientificbio.c ... estriction-enzymes/)。这种情况下最好是采用分步酶切法,即先用一种酶在适宜buffer下酶切一段时间,之后用PCR纯化试剂盒(axygen的就可以)回收DNA,之后加入另一种酶和buffer再酶切一定时间。
另外关于你的酶切体系里4ul 的总酶量过多,通常1小时消化1ugDNA只需要1unit的酶,大多数市售内切酶是10units/ul的,消化时1ul即可。内切酶在储存时需要加入50%的甘油,而酶切体系中甘油的比例超过10%就可以完全抑制内切酶的活性。按照你的酶切体系计算,4ul 的内切酶就会为总体系带入5%的甘油,一定会对DNA的消化造成影响。建议内切酶的量只占体系总量的5%,并不是越多越好。
27楼2013-01-30 14:01:48
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mascotte

金虫 (正式写手)

单位酶活力的定义就是完全消化1ug lamda DNA所需要的酶量,通常是10倍过量消化的,即1ul。
你的的双酶切buffer是什么?
29楼2013-01-30 14:43:48
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mascotte

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


fayzhao: 金币+1 2013-02-02 12:20:33
http://www.thermoscientificbio.c ... nzymes/conventional
这个表里面BglII在1Xtango里只有0-20的活性,kpnI 只有20-50的活性,这是fementas公司的网站。
31楼2013-01-30 19:11:11
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