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求高手帮忙解释下MEGA计算核酸转换/颠换比率的结果
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应用MAGA5.0软件，计算转换/颠换比率，对计算出来的结果疑惑，请大家帮忙解释下，万分感谢！ 1、si=0.00，怎么有R=0.36？另外“转换位点数+颠换位点数”应该等于变异位点数吧，？ 2、ii = 935.00是怎么计算出来的，平均值？ 3、TT、TA、TG、Domain Info等都表示什么意思？ 软件计算结果如下： All frequencies are averages (rounded) over all taxa. ii = Identical Pairs si = Transitionsal Pairs sv = Transversional Pairs R = si/sv Domain ii si sv R TT TC TA TG CT CC CA CG AT AC AA AG GT GC GA GG Total Domain Info 1 Avg 935.00 0.00 1.00 0.36 345.00 0.00 0.00 0.00 0.00 168.00 0.00 0.00 0.00 0.00 278.00 0.00 0.00 0.00 0.00 144.00 935.77 Data  未命名.jpg |
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2楼2013-01-22 17:09:00