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DNA甲基化实验中的疑惑
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DNA甲基化实验中的疑惑
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最近一直在做种子的甲基化,从种子胚中提取的DNA,质量和浓度都还不错,260/280和260/230均在1.9-2.0之间,浓度2000μg/L,酶切用的是ECORI和HPAII(快酶),连接、预扩、选扩,效果一直不是很满意,聚丙烯酰胺凝胶电泳的效果不是很好,时而可以跑出条带,时而弥散一片。
有几个问题:1、酶切后用不用纯化,如果不纯化,连接接头的时候容易吗?连接后如何检测是否连接上了?2、有没有做过DNA甲基化分析的高手(MSAP),求各个步骤的体系?3、在这个实验过程中,最经常出现的问题是什么?
先谢谢各位高手了
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2013-01-20 16:07:51
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2013-04-18 08:24:38
请问您用的内切酶是哪个公司的?我也在做MSAP 最后条带弥散一片 可能是你的DNA破坏了 也就是说DNA断掉了 以至于部分接头没接上 检测到的是接头片段 及短的DNA
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3楼
2013-02-27 13:06:14
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2013-04-18 08:24:29
1 最好不要纯化,会对DNA产生影响
2 如果有材料可以重新提一下DNA,重新连接、、、、、、,如果还不行,可能就是酶的毛病了,重新稀释一下。
做分子实验必须认真,每个环节都很重要,否则,不容易成功。
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2楼
2013-02-01 21:40:40
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您甲基化的盒子使用的是那个公司的呢?
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2013-04-17 21:01:17
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4楼
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at 2013-04-17 21:01:17
您甲基化的盒子使用的是那个公司的呢?
没用盒子,全是自己配的试剂,买的内切酶,fastdigest
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5楼
2013-04-17 21:18:37
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