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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 紧急求助！我的RT-PCR数据怎么做成可以发文章的图？
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tmdabc

金虫 (小有名气)

[求助] 紧急求助！我的RT-PCR数据怎么做成可以发文章的图？

急求大侠指点，
（我的数据，还有处理到2^-ΔΔt这一步出现的问题1，都在附件里，）
问题1，如下，我测上清HBV拷贝数，没有内参，看RNAi、drug及联用作用，delta delta t是用实验平均值减去空白对照平均值。
        control        RNAi               drug             RNAi+drug
        21.13        25.63        22.81        23.41
        23.37        23.45        24.44        24.4
        23.2                22.96        23.07         23.78
平均22.566         24.013        23.44        23.86333333
        0        1.446666667        0.873333        1.296666667               ：减去空白对照
                                      
        1        0.366868091        0.545884132        0.407065634       ： 2^(-△△Ct)
問題        ：
处理效果强弱顺序CT值和2^(-△△Ct)不匹配-----因为drug的△△Ct结果在0-1，所以。。。
问题2，
应该做什么样的图？
xy坐标分别写什么？
误差棒怎么加？
显著性怎么标注？
图示标注解释怎么写？



O(∩_∩)O谢谢[ Last edited by tmdabc on 2013-1-18 at 20:41 ]
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  • 附件 1 : 緊急求助.xls
    • 2013-01-18 18:58:49, 10 K

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@西瓜 @sail000000 @137167741 @蜡笔小砖块 @bloodwar @chenyuqin @cicelyzh @清风流水656 @decloud... 查看更多

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1楼2013-01-18 19:04:05
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tmdabc

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by runying36 at 2013-01-19 19:44:14
首先LZ考虑一下，你这样急急忙忙地做的结果是不是符合逻辑，都没有内参，我想你投的期刊能接受这样的结果吗？
下面我提供的是关于ΔΔCt方法分析的统计表示，这并不代表我认同LZ可以用这个方法统计出你所需要的图。 ...

谢谢。
内参应该都是0啊，因为处理过的样品里面不可能有GAPDH、actin什么的！
赞一下 回复此楼
11楼2013-01-19 20:14:03
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海骄子

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
看你数据，只做了一次测量，无法进行显著性标注等操作！！
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2楼2013-01-18 20:52:32
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dongyan08

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
是啊，只做了一次试验，必须做三次分析数据才有意义，根本就没法进行显著性分析，而且没有内参， 2^(-△△Ct)根本就不能这样算，应做差异分析图，X是组别 RNAi \drug \ RNAi+drug，Y就是2^(-△△Ct)，误差棒作图时加 ，显著性要先分析。
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

tmdabc
3楼2013-01-18 21:12:41
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tmdabc

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by dongyan08 at 2013-01-18 21:12:41
是啊，只做了一次试验，必须做三次分析数据才有意义，根本就没法进行显著性分析，而且没有内参， 2^(-△△Ct)根本就不能这样算，应做差异分析图，X是组别 RNAi \drug \ RNAi+drug，Y就是2^(-△△Ct)，误差棒作图时加 ...

能再详细点么？谢谢。
差异分析图？
2^(-△△Ct)结果效果顺序和CT值不同啊
赞一下 回复此楼
4楼2013-01-19 01:09:06
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