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dfl204

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] BAC克隆相关问题请教

1. 找别的课题组拿了一个BAC的质粒DNA,氯霉素抗性,外源片段180kb左右。想转到大肠杆菌中扩繁,但是36小时才有克隆,菌落和质粒PCR均为阴性,一般这种情况正常长出克隆需要多长时间?如何提高转化效率?
Ps: 感受态细胞是商业化的,热激转化和电转化的都试过。

2. 如果在此BAC基础上想酶切后回收30-50kb左右的片段,如果没有脉冲电泳仪,有什么好的方法可以完成。有人建议蔗糖梯度离心,但是没有找到相应的纯化特定大小DNA的方法,纯化蛋白质的倒是有很多。 有哪位赐教相应的详细步骤?

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dshlove

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
dfl204: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢,如你所说,还有一些细节需要再多注意一点。 2013-01-16 12:18:35
个人建议
大肠杆菌一般过夜就能长出克隆,如果你的感受态没有问题的话。
转化效率的影响最大的两个因素就是质粒浓度和感受态。商业化感受态批次不同有时候转化差很多,这得注意。
还有就是质粒的纯度和转化加入的量的问题了,一般1ng的DNA就能饱和50ul的感受态的。
至于大质粒酶切回收小片段,我没成功过。不能瞎说。
能帮到就这么多了……
2楼2013-01-16 10:58:51
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dshlove

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


dfl204: 金币+1, 有帮助, 谢谢 2013-01-17 07:49:03
引用回帖:
2楼: Originally posted by dshlove at 2013-01-16 10:58:51
个人建议
大肠杆菌一般过夜就能长出克隆,如果你的感受态没有问题的话。
转化效率的影响最大的两个因素就是质粒浓度和感受态。商业化感受态批次不同有时候转化差很多,这得注意。
还有就是质粒的纯度和转化加入的 ...

嗯,其实有时候各方面都注意了,就是出不来东西,慢慢来,希望实验顺利啊。
3楼2013-01-16 14:39:57
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浅歌99

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by dshlove at 2013-01-16 14:39:57
嗯,其实有时候各方面都注意了,就是出不来东西,慢慢来,希望实验顺利啊。...

楼主加油!请问你用的哪一种质粒啊?我最近要开始建BAC文库,正在选择质粒载体,希望能得到一些帮助~
4楼2013-07-15 17:12:22
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dfl204

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 浅歌99 at 2013-07-15 18:12:22
楼主加油!请问你用的哪一种质粒啊?我最近要开始建BAC文库,正在选择质粒载体,希望能得到一些帮助~...

pIndigoBAC-5
5楼2013-07-15 18:41:18
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浅歌99

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by dfl204 at 2013-07-15 18:41:18
pIndigoBAC-5...

实验新手,而且实验室之前没人做过,所以可能要向楼主多多讨教,希望您不要厌烦呀,非常感谢
6楼2013-07-19 15:35:40
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浅歌99

新虫 (初入文坛)

有一个问题想请教你,细胞核包埋块在进行脉冲电泳大片段选择的时候,是一次性选择了吗?还是每几个包埋块选择一次。若是每几个包埋块选择一次的话,是需要不断重复这一步骤的吧?
大概持续多长时间啊?
7楼2013-08-02 10:41:12
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ccppff123

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by dshlove at 2013-01-16 10:58:51
个人建议
大肠杆菌一般过夜就能长出克隆,如果你的感受态没有问题的话。
转化效率的影响最大的两个因素就是质粒浓度和感受态。商业化感受态批次不同有时候转化差很多,这得注意。
还有就是质粒的纯度和转化加入的 ...

最近一直在做BAC质粒的酶切再环化试验,请问你用的什么方法进行质粒的提取的,我用OMEGA的低拷贝质粒Kit提取,效果一直不太好。
8楼2015-04-07 16:21:00
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cry_2013

木虫 (正式写手)

不知道楼主现在还来不来小木虫,我现在在做BAC克隆,刚开始,有点小问题想要问问 楼主,希望能得到楼主的回复,期待中
9楼2015-05-16 21:02:52
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