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xk6891

至尊木虫 (著名写手)

[求助] vmd如何远程加载分子动力学轨迹？

听说在服务器上安装vmd之后，可以在远程客户端使用vmd来加载分子动力学轨迹文件，哪位大牛指导一下是如何做到的?
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1楼 2013-01-15 14:01:11
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abdoman

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+3, 鼓励交流 2013-01-15 16:04:36
xk6891: 金币+3, ★有帮助, 额，结构朝向如果一次一次的修改确实不方便，但确实是一种方法 2013-01-16 15:42:10
引用回帖:
5楼: Originally posted by xk6891 at 2013-01-15 14:39:53
恩，版主建议的是。就是cpmd模拟产生的xyz文件。我主要是想在家里用客户端打开远端集群服务器上面的vmd程序，这样加载轨迹时，就不需要download这些超大的轨迹文件了，不然download过程太慢了。...

你是需要调用图形吗？用terminal吗？
远程调用图形不一定快哦。
到是可以按照版主的建议，文本界面，用命令加载，然后远程传输最后的结果。
就是不知道结构位置，朝向是否合理。不过可以先一试。
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Youcompleteme.
7楼2013-01-15 15:36:37
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
听说VMD 的手册介绍的比较清楚，楼主不妨去看看手册。
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2楼2013-01-15 14:04:43
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xk6891

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-01-15 14:04:43
听说VMD 的手册介绍的比较清楚，楼主不妨去看看手册。

看过，没找到。好像需要一个东西，才能做到，忘了是什么了
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人生自古多险阻，勤者自得天酬助。试问否泰何所依，枯藤老枝待新抽。临渊踌躇终迈步，振翅鹏起云霄冲。似是前程甚堪忧，他日振臂揽苍穹。
3楼2013-01-15 14:11:02
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by xk6891 at 2013-01-15 14:11:02
看过，没找到。好像需要一个东西，才能做到，忘了是什么了...

那最起码你也应该把你是用什么软件做的MD模拟吧？不同的软件产生的分子动力学轨迹文件格式不一样，在论坛里提问最好能够把问题描述的详细一些，这样大家的回复也就更有针对性。你把你的问题描述清楚了，然后搜索关键词，也许论坛里就已经有答案了，不信你试试。
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4楼2013-01-15 14:30:34
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