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xk6891

至尊木虫 (著名写手)

[求助] vmd如何远程加载分子动力学轨迹?

听说在服务器上安装vmd之后,可以在远程客户端使用vmd来加载分子动力学轨迹文件,哪位大牛指导一下是如何做到的?
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人生自古多险阻,勤者自得天酬助。试问否泰何所依,枯藤老枝待新抽。临渊踌躇终迈步,振翅鹏起云霄冲。似是前程甚堪忧,他日振臂揽苍穹。
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abdoman

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+3, 鼓励交流 2013-01-15 16:04:36
xk6891: 金币+3, 有帮助, 额,结构朝向如果一次一次的修改确实不方便,但确实是一种方法 2013-01-16 15:42:10
引用回帖:
5楼: Originally posted by xk6891 at 2013-01-15 14:39:53
恩,版主建议的是。就是cpmd模拟产生的xyz文件。我主要是想在家里用客户端打开远端集群服务器上面的vmd程序,这样加载轨迹时,就不需要download这些超大的轨迹文件了,不然download过程太慢了。...

你是需要调用图形吗?用terminal吗?
远程调用图形不一定快哦。
到是可以按照版主的建议,文本界面,用命令加载,然后远程传输最后的结果。
就是不知道结构位置,朝向是否合理。不过可以先一试。
Youcompleteme.
7楼2013-01-15 15:36:37
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
听说VMD 的手册介绍的比较清楚,楼主不妨去看看手册。
2楼2013-01-15 14:04:43
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xk6891

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-01-15 14:04:43
听说VMD 的手册介绍的比较清楚,楼主不妨去看看手册。

看过,没找到。好像需要一个东西,才能做到,忘了是什么了
人生自古多险阻,勤者自得天酬助。试问否泰何所依,枯藤老枝待新抽。临渊踌躇终迈步,振翅鹏起云霄冲。似是前程甚堪忧,他日振臂揽苍穹。
3楼2013-01-15 14:11:02
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by xk6891 at 2013-01-15 14:11:02
看过,没找到。好像需要一个东西,才能做到,忘了是什么了...

那最起码你也应该把你是用什么软件做的MD模拟吧?不同的软件产生的分子动力学轨迹文件格式不一样,在论坛里提问最好能够把问题描述的详细一些,这样大家的回复也就更有针对性。你把你的问题描述清楚了,然后搜索关键词,也许论坛里就已经有答案了,不信你试试。
4楼2013-01-15 14:30:34
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