24小时热门版块排行榜    

查看: 3756  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xk6891

至尊木虫 (著名写手)

[求助] vmd如何远程加载分子动力学轨迹?

听说在服务器上安装vmd之后,可以在远程客户端使用vmd来加载分子动力学轨迹文件,哪位大牛指导一下是如何做到的?
回复此楼
人生自古多险阻,勤者自得天酬助。试问否泰何所依,枯藤老枝待新抽。临渊踌躇终迈步,振翅鹏起云霄冲。似是前程甚堪忧,他日振臂揽苍穹。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abdoman

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+3, 鼓励交流 2013-01-15 16:04:36
xk6891: 金币+3, 有帮助, 额,结构朝向如果一次一次的修改确实不方便,但确实是一种方法 2013-01-16 15:42:10
引用回帖:
5楼: Originally posted by xk6891 at 2013-01-15 14:39:53
恩,版主建议的是。就是cpmd模拟产生的xyz文件。我主要是想在家里用客户端打开远端集群服务器上面的vmd程序,这样加载轨迹时,就不需要download这些超大的轨迹文件了,不然download过程太慢了。...

你是需要调用图形吗?用terminal吗?
远程调用图形不一定快哦。
到是可以按照版主的建议,文本界面,用命令加载,然后远程传输最后的结果。
就是不知道结构位置,朝向是否合理。不过可以先一试。
Youcompleteme.
7楼2013-01-15 15:36:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
听说VMD 的手册介绍的比较清楚,楼主不妨去看看手册。
2楼2013-01-15 14:04:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xk6891

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-01-15 14:04:43
听说VMD 的手册介绍的比较清楚,楼主不妨去看看手册。

看过,没找到。好像需要一个东西,才能做到,忘了是什么了
人生自古多险阻,勤者自得天酬助。试问否泰何所依,枯藤老枝待新抽。临渊踌躇终迈步,振翅鹏起云霄冲。似是前程甚堪忧,他日振臂揽苍穹。
3楼2013-01-15 14:11:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by xk6891 at 2013-01-15 14:11:02
看过,没找到。好像需要一个东西,才能做到,忘了是什么了...

那最起码你也应该把你是用什么软件做的MD模拟吧?不同的软件产生的分子动力学轨迹文件格式不一样,在论坛里提问最好能够把问题描述的详细一些,这样大家的回复也就更有针对性。你把你的问题描述清楚了,然后搜索关键词,也许论坛里就已经有答案了,不信你试试。
4楼2013-01-15 14:30:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +9 雨打竹帘 2026-08-30 13/650 2026-09-03 08:16 by kudofaye
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +8 gdd2018 2026-08-28 13/650 2026-09-03 06:22 by 羽毛枫f
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ero8OE6tv9cu 2026-09-02 4/200 2026-09-03 03:14 by rM1TE0WVDIIY
[博后之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ero8OE6tv9cu 2026-09-02 6/300 2026-09-02 23:59 by rM1TE0WVDIIY
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +14 Kittylucky 2026-08-27 15/750 2026-09-02 19:35 by liumei0601
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题 +7 瞬息宇宙 2026-09-01 14/700 2026-09-02 17:33 by ma0526
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +5 瞬息宇宙 2026-08-31 5/250 2026-09-02 10:13 by 雨冰共舞
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
信息提示
请填处理意见