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杨树林117

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 植物RNA电泳图分析

提取植物叶片RNA,第一张图片是用CTAB法提取,第二张是trizol提取,为什么CTAB法提取的条带这么多,trizol就只有三条?CTAB法提取为什么会有基因组DNA的污染呢,做了好多次一直都是这样?还有trizol提取第三条带很亮,是因为降解的原因吗?新手,请大家帮忙分析一下,万分感谢

eric 2012-08-16 13hr 11min.jpg(33.82KB)
http://kuai.xunlei.com/d/LnU4DanhHSfqUAQA9c5?p=130497
eric 2012-12-08 11hr 50min.jpg(52.88KB)
http://kuai.xunlei.com/d/LnU4DavhKCfqUAQA3ac?p=130497
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杨树林117

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-01-07 13:11:00
顺便说一下,不说DNA污染的问题的话,你的CTAB法提的RNA质量好像更好一些。提植物RNA时候用叶子提除了一般真核生物的的带以外,有叶绿体的原核RNA带是很普通的。

那为什么一种材料CTAB法提的条带多,trizol少呢,谢谢您的解答
4楼2013-01-07 16:42:02
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-01-07 12:09:32
杨树林117: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-01-07 16:29:27
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2013-01-07 17:06:06
任何方法提RNA都可能有基因组DNA的污染,多少的确和方法有关。RNA样品一般需要用DNase消化。不清楚为什么你的CTAB法有很多带,是不是包含了叶绿体中的DNA和RNA呢?你试试消化一下CTAB法提的样品。Trizol法提的RNA降解严重,5S太亮,26S/18S的比例差。
2楼2013-01-07 11:39:26
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

顺便说一下,不说DNA污染的问题的话,你的CTAB法提的RNA质量好像更好一些。提植物RNA时候用叶子提除了一般真核生物的的带以外,有叶绿体的原核RNA带是很普通的。
3楼2013-01-07 13:11:00
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
杨树林117: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 谢谢您 2013-01-08 09:46:56
引用回帖:
4楼: Originally posted by 杨树林117 at 2013-01-07 16:42:02
那为什么一种材料CTAB法提的条带多,trizol少呢,谢谢您的解答...

这个还真不知道了。可能是两种方法裂解程度不同,所以TRIZOL没有得到叶绿体的RNA?
5楼2013-01-08 07:41:07
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