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yujitianqing

铁虫 (正式写手)

[求助] 生物信息学关于序列比对使用的矩阵问题

请教序列比对使用的PAM、BLOSUM矩阵的定义、作用;BLAST使用的是哪一矩阵及原因。谢谢……
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yujitianqing

铁虫 (正式写手)

多谢多谢!学习了…

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2013-01-05 21:10:25
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yujitianqing

铁虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by _锦瑟薇薇 at 2013-01-05 14:57:30
BLAST是基本局部比对搜索工具。查询序列与数据库序列间非常短的片段对,然后向两端无空隙的扩展种子,直到达到最大可能计分。查询蛋白质序列数据库可以使用BLOSUM62矩阵打分。计算速度提高很快。
纯码字,累屎了:: ...

7楼2013-01-06 11:28:05
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