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[求助]
如何模拟带末端的双链dna 新手求助 万分感谢
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想做小分子DNA的闭环开环模拟计算，DNA的5‘是带有互补的单链，举个例子： Cy3-CAGAATCCGGGGGG CCCCCCGGATTCTG-Cy5 假设6个碱基对长度，overhangs为8。用什么软件可以得到有坐标的pdb文件？本人刚接触分子模拟，谢谢大家！ [ Last edited by sagp on 2013-1-2 at 08:00 ] |
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 Gromacs |
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
sagp: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢相助 2013-01-03 11:27:25
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http://www.ks.uiuc.edu/Training/Tutorials/ Bionanotechnology Modeling Nanopores for Sequencing DNA 这个PDF里面介绍的非常详细 还有一种办法是你通过hyperchem ，里面有个碱基库，根据你的需要去建立DNA的顺序 |
2楼2013-01-03 10:00:07
3楼2013-01-03 10:30:06
4楼2013-01-03 11:27:40