24小时热门版块排行榜    

查看: 701  |  回复: 3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xy656691

金虫 (正式写手)

[求助] 关于引物设计的一些问题

在酶切位点加保护碱基时,是只在酶切位点的5'端加保护碱基还是酶切位点的两端都加呢?
假如我要设计A基因的引物,那么我设计引物时,是以A的全基因组作为模板还是CDNA,亦或是CDS序列,这三种序列有什么区别?什么条件下用何种序列呢?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xy656691

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2012-12-22 11:58:13
保护碱基是在引物的5'加的,根据PCR的原理,引物5'端和模板不需要很好的互补,所以可以引入酶切位点和保护碱基。引物的3'端最好和模板完全互补才能和模板很好的anealing。
引物设计以什么序列为模板要看你做PCR的目 ...

嗯,谢谢。酶切位点是一段碱基序列,在引物的5'端,那所加的保护碱基是在酶切位点序列的5'端还是3'端?
3楼2012-12-22 12:58:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
保护碱基是在引物的5'加的,根据PCR的原理,引物5'端和模板不需要很好的互补,所以可以引入酶切位点和保护碱基。引物的3'端最好和模板完全互补才能和模板很好的anealing。
引物设计以什么序列为模板要看你做PCR的目的是希望扩增什么,具体情况具体分析。
2楼2012-12-22 11:58:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by xy656691 at 2012-12-22 12:58:03
嗯,谢谢。酶切位点是一段碱基序列,在引物的5'端,那所加的保护碱基是在酶切位点序列的5'端还是3'端?...

保护碱基加在酶切位点的5'端。就是5'-XXXX-酶切位点-正常引物序列-3’
4楼2012-12-23 00:23:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +32 医学老男孩 2026-08-13 74/3700 2026-08-16 21:05 by 医学老男孩
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +13 archvillain 2026-08-15 25/1250 2026-08-16 20:13 by zhaosm1982
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +3 Tide man 2026-08-14 3/150 2026-08-16 17:47 by jurkat.1640
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +9 Ldrop2023 2026-08-13 9/450 2026-08-16 13:24 by wukun_007
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +11 家与远方 2026-08-10 16/800 2026-08-16 10:28 by ray43
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +6 wangze12014 2026-08-14 7/350 2026-08-15 20:12 by gltch
[基金申请] filecode +8 cratir 2026-08-14 12/600 2026-08-15 18:08 by zyfgau
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
信息提示
请填处理意见