应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » dump出文件显示问题
51/1返回列表
查看: 1664  |  回复: 16
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zhang_jaj

木虫 (正式写手)

[求助] dump出文件显示问题

我的体系一个fcc排列的ar原子，用dump输出的lammpstrj格式的文件，是多帧的，而且ID是打乱的，求了cna，后面带着这个值，想在vmd里面显示出不同cna值得颜色，所有帧都显示，然后做成动画，不知道有什么合适的方法吗？

[ Last edited by zhang_jaj on 2012-12-17 at 20:25 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

VMD 软件

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2012-12-17 20:06:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhang_jaj

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ddll_slsl at 2012-12-18 08:57:04
可以在VMD里设置，如分子标识等。。 VMD可以完成你要的一切。。

能说的详细点吗，非常感谢！看其他地方的有人是写个脚本实现，但是说对于多核输出的不能每帧都显示。我就是想显示lammps输出的c_cna的值
赞一下 回复此楼
5楼2012-12-18 21:03:18
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-12-18 15:43:22
可以在VMD里设置，如分子标识等。。 VMD可以完成你要的一切。。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2012-12-18 08:57:04
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ddll_slsl at 2012-12-18 08:57:04
可以在VMD里设置，如分子标识等。。 VMD可以完成你要的一切。。

顶楼上

搞MD，真应该好好学习一下VMD 的使用。
赞一下 回复此楼
3楼2012-12-18 15:44:00
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyujia

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-12-18 21:57:48
zhang_jaj: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 算然不是vmd，但是目的达到了，谢谢 2012-12-20 19:01:54
我建议你用Atomeye，牛人李巨写的，非常好用，可以做出非常漂亮的图，也可以做成动画。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2012-12-18 16:49:09
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭