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基于Illumina RNA-Seq短序列的转录组从头组装软件比较与优化 已有5人参与
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这个文章提供了N50，N90的准确定义和相关的程序。欢迎大家引用这个文章和程序。引用程序时，请一定说明出处。 这个文章提供了N50，N90的准确定义和相关的程序。欢迎大家引用这个文章和程序。引用程序时，请一定说明出处。 http://journal.kib.ac.cn/CN/abstract/abstract3092.shtml |
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gaoyang636
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感谢你的建议，我当时没多想，以为不大会有人感兴趣，而感兴趣的人也许都看过了。 现在附上paper 1 全文链接 http://www.plosone.org/article/i ... ournal.pone.0031410 #注：PLoS ONE为Open acess，不需要购买权限，所以我就不上传了，仅提供链接。 2 全文见此 http://1000eb.com/2hd1 # 发现小木虫高级回复只能上传图片附件，文件附件需要使用网盘，所以用了一个别人已经上传的地址，我刚才已经下载验证ok了。 |
7楼2012-12-18 09:07:05
gaoyang636
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wizardfan: 金币+2, 谢谢分享 2012-12-15 07:39:20
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我也来分享两个类似的paper吧  # 454数据的denovo拼接软件比较：Mundry, M. et.al. 2012. Evaluating characteristics of de novo assembly software on 454 transcriptome data: a simulation approach. PLoS ONE # RNA-seq数据分析软件的比较（包含了denovo拼接和mapping，以及定量，寻找差异基因等）：Manuel Garber. et.al. 2011. Computational methods for transcriptome annotation and quantification using RNA-seq. Nature Methods |
2楼2012-12-14 17:14:37
heima123
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