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基于Illumina RNA-Seq短序列的转录组从头组装软件比较与优化 已有5人参与
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这个文章提供了N50，N90的准确定义和相关的程序。欢迎大家引用这个文章和程序。引用程序时，请一定说明出处。 这个文章提供了N50，N90的准确定义和相关的程序。欢迎大家引用这个文章和程序。引用程序时，请一定说明出处。 http://journal.kib.ac.cn/CN/abstract/abstract3092.shtml |
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heima123
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
wizardfan: 金币+2, 谢谢分享 2012-12-15 07:39:20
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
wizardfan: 金币+2, 谢谢分享 2012-12-15 07:39:20
我也来分享两个类似的paper吧  # 454数据的denovo拼接软件比较：Mundry, M. et.al. 2012. Evaluating characteristics of de novo assembly software on 454 transcriptome data: a simulation approach. PLoS ONE # RNA-seq数据分析软件的比较（包含了denovo拼接和mapping，以及定量，寻找差异基因等）：Manuel Garber. et.al. 2011. Computational methods for transcriptome annotation and quantification using RNA-seq. Nature Methods |
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