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luke11

金虫 (小有名气)

[求助] 嗜热酶分子模拟对比

两种不同来源的酶热稳定性差异较大。能不能用分子模拟的方法比较其结构?寻找热稳定性的原因。
或是有没有类似文献?
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luke11

金虫 (小有名气)

引用回帖:
10楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-12-12 10:18:49
其实这个问题不用考虑的太复杂,哈哈~你是已有实验数据的,做计算只是为了解释你的实验结果而已~...

这个想法好
11楼2012-12-12 12:54:23
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
luke11: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2012-12-11 10:09:30
可以的~
思路如下:
1.建立两种酶的三级结构模型-同源模建
2.进行分子动力学模拟-设置在不同温度下,比如300K, 400K. 500K,通过轨迹分析了解可能优先变性的区域,比较稳定的氢键、盐桥作用等,从而从结构上说明热稳定性差异的原因
2楼2012-12-10 20:43:56
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luke11

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-12-10 20:43:56
可以的~
思路如下:
1.建立两种酶的三级结构模型-同源模建
2.进行分子动力学模拟-设置在不同温度下,比如300K, 400K. 500K,通过轨迹分析了解可能优先变性的区域,比较稳定的氢键、盐桥作用等,从而从结构上说明热 ...

能不能发篇类似文献?
3楼2012-12-11 10:10:18
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

以这些词作为关键词 enzyme thermal stability molecular dynamics 在google 学术搜索里搜搜就能找到很多~先看看~呵呵
4楼2012-12-11 10:55:33
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