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summer2771

木虫 (正式写手)

[求助] qPCR怎样算出2-ΔΔCT值,还有标准差的那种?

求助,像我这样的数据,怎么能够在Con和Treat组都得到3个2-ΔΔCT值啊?
我自己琢磨着如果都是用treat跟Con比较的话,那等于说从6个中选2个出来两两比较,不是不止3个值了吗?
虽然2-ΔCT值也能用来比较,但是我还是想用2-ΔΔCT法,请大家指教!不胜感激!

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gyesang

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【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
7楼: Originally posted by summer2771 at 2012-12-08 21:39:57
我这就是一个基因啊,比如说我要比较干预手段对A基因表达的影响,实验组取3只老鼠,对照组取3只老鼠,这两个组的各3只老鼠都会有一个内参值和一个目的基因A的CT值,那不就是我上面对应的1、2、3号吗?
我现实的实 ...

我大致明白你的意思了,
你的意思是,你对照组有3只老鼠,实验组有3只老鼠,然后拿这六只老鼠做qPCR,即
对照组老鼠
1 基因 - 内参 = ΔCT1
2 基因 - 内参 = ΔCT2
3 基因 - 内参 = ΔCT3
这里的三个ΔCT要取平均值了,重复的原则不就是让取均值吗 为 ΔCT对照

实验组老鼠
1 基因 - 内参 = ΔCT1
2 基因 - 内参 = ΔCT2
3 基因 - 内参 = ΔCT3
这里的三个ΔCT也要取平均值 为 ΔCT实验

然后进行ΔΔCT计算
         对照                  实验
ΔCT对照 - ΔCT对照      ΔCT实验 - ΔCT对照

然后算出以2(E)为base的指数2^-ΔΔCT

以上仅为个人见解,不对请指正啊

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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
8楼2012-12-08 23:34:42
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

楼主问题描述的不清楚,哪个是你的内参,哪个是目的基因Ct值

各样品先要把内参调齐然后再 比较,才有意义,照现有的数据,楼主这组数据中包含一个内参基因和两个目的基因?得到两个2-ΔΔCT值
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2012-12-08 20:29:03
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summer2771

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gyesang at 2012-12-08 20:29:03
楼主问题描述的不清楚,哪个是你的内参,哪个是目的基因Ct值

各样品先要把内参调齐然后再 比较,才有意义,照现有的数据,楼主这组数据中包含一个内参基因和两个目的基因?得到两个2-ΔΔCT值

版主好!
我的第一列是目的内参CT,第二列是内参CT
3楼2012-12-08 20:42:43
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summer2771

木虫 (正式写手)

版主,我的第一列是目的CT值,第二列是内参CT值!
4楼2012-12-08 20:52:45
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