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WJ-MS

新虫 (小有名气)

[求助] LAMMPS运行结果出现nan

改写了一段小的程序,运行计算的时候,屏幕上热力学输出都只显示nan,见附图,这是怎么回事阿?

Screenshot.png
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Bessel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2013-01-19 23:14:47
引用回帖:
15楼: Originally posted by WJ-MS at 2012-12-12 05:14:26
我在上次那个in文件里面加了一个minimize命令,但是运行计算好像没有反应啊,你能不能帮我看看呢
# 3d NaCl melt

units                metal
dimension 3
boundary  p p p
atom_style        charge

region                   regbox blo ...

有反应啊,不过minimization之后能量反倒更大了,唉,我也没做过带电系统的,不敢瞎评论。
Setting up minimization ...
Memory usage per processor = 8.75168 Mbytes
Step Temp E_pair E_mol TotEng Press
       0            0     3283.825            0     3283.825    1841942.5
       1            0    2201.9244            0    2201.9244    1191267.3
       2            0 1.1420382e+28            0 1.1420382e+28 7.3432144e+30
Loop time of 0.0345552 on 1 procs for 2 steps with 212 atoms

Minimization stats:
  Stopping criterion = linesearch alpha is zero
  Energy initial, next-to-last, final =
         3283.82497763      2201.92444207  1.14203823754e+28
  Force two-norm initial, final = 20954.6 2.00103e+32
  Force max component initial, final = 11759.7 1.14428e+32
  Final line search alpha, max atom move = 2.10676e-16 2.41072e+16
  Iterations, force evaluations = 2 40
16楼2012-12-12 15:36:20
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-12-11 21:30:01
WJ-MS: 金币+3, ★★★很有帮助 2012-12-17 09:26:38
我记得这样是初始模型建立的好不引起的。还有把你的 in文件贴出来,让大家看看

你有木有先进行能量最小化?

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2楼2012-12-07 14:04:29
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Bessel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-12-08 20:08:34
初始构型的问题,在run之前先minimize一下。

http://lammps.sandia.gov/doc/minimize.html

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3楼2012-12-08 04:58:17
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tracel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-12-08 20:08:51
如前几楼说的,构型不好,导致能量太大,超出了lammps所能记录的数字大小。

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4楼2012-12-08 19:47:03
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